39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2442 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.2 
 
 		 1842 aa  92.8  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  40.71 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  29.79 
 
 		 1882 aa  82  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 589 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  42 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  32.56 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  36.21 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  33.1 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  32.06 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 399 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  35.04 
 
 		 730 aa  72  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  29.03 
 
 		 1518 aa  72  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  30.82 
 
 		 269 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  30.48 
 
 		 460 aa  68.9  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  34.5 
 
 		 355 aa  68.9  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1052 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  33.61 
 
 		 2495 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  38.82 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  27.92 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  30.82 
 
 		 2392 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  33.33 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1247 aa  59.7  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  32.61 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  29.17 
 
 		 1732 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  27.01 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  29.21 
 
 		 158 aa  52.8  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  30.77 
 
 		 476 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  31.03 
 
 		 538 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  29.22 
 
 		 1017 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1055 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  28.03 
 
 		 320 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  29.66 
 
 		 361 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  27.97 
 
 		 269 aa  47.8  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  30.43 
 
 		 313 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  33.75 
 
 		 380 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  27.33 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  25.74 
 
 		 278 aa  42.4  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  28.02 
 
 		 691 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>