34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2178 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  623  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2179  hypothetical protein  49.02 
 
 
133 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0793201  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2180  hypothetical protein  37.16 
 
 
126 aa  89.7  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  32.24 
 
 
1882 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  30.2 
 
 
1518 aa  73.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  34.38 
 
 
1052 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  31.29 
 
 
395 aa  72.4  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  33.33 
 
 
1842 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  25.42 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  32.1 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  27.39 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  30.67 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  25.12 
 
 
1732 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
399 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  30.63 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  32.18 
 
 
730 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  37.06 
 
 
352 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  35.43 
 
 
456 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  28.67 
 
 
460 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  28.24 
 
 
2495 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 
589 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  27.61 
 
 
2392 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  35.29 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  36.19 
 
 
203 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  30.21 
 
 
691 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  27.34 
 
 
1247 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  32.69 
 
 
269 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1992  hypothetical protein  33.01 
 
 
111 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375706  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  30.43 
 
 
231 aa  46.6  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  27.27 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  30.7 
 
 
434 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  25 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  26.67 
 
 
254 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>