20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1337 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1016    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  33.57 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  33.56 
 
 		 1052 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  28.48 
 
 		 1518 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  32.19 
 
 		 1882 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  32.87 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  27.81 
 
 		 1842 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  47.17 
 
 		 2392 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  34.78 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  31.29 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  28.68 
 
 		 1732 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  38.6 
 
 		 361 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  29.46 
 
 		 538 aa  49.7  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  35.05 
 
 		 2495 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  30.91 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  30.89 
 
 		 730 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  35.48 
 
 		 293 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1247 aa  47  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1992  hypothetical protein  32.35 
 
 		 111 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375706  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  36.25 
 
 		 458 aa  44.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>