34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1895 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  100 
 
 		 538 aa  1090    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  30.71 
 
 		 456 aa  124  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 589 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 399 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  27.91 
 
 		 352 aa  103  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  24.11 
 
 		 2495 aa  85.9  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1055 aa  85.5  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  34.27 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  28.17 
 
 		 1518 aa  76.6  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  48.48 
 
 		 1514 aa  73.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  46.97 
 
 		 2821 aa  72.4  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  48.44 
 
 		 1475 aa  69.7  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  31.34 
 
 		 203 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  31.21 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  27.79 
 
 		 1882 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  30.92 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  24.27 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  22.92 
 
 		 730 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1052 aa  62.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  33.09 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  29.24 
 
 		 2392 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  30.66 
 
 		 293 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  22.67 
 
 		 460 aa  55.1  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  30 
 
 		 1732 aa  54.3  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  31.03 
 
 		 231 aa  51.2  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  29.46 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  24.22 
 
 		 1842 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1247 aa  47.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  27.47 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.03 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  30.26 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  28.07 
 
 		 657 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  30.07 
 
 		 1017 aa  44.3  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>