35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0741 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  100 
 
 
657 aa  1337    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  65.82 
 
 
158 aa  190  9e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  28.27 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  31.21 
 
 
1882 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.75 
 
 
1052 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  28.67 
 
 
691 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  30.12 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  50.65 
 
 
1003 aa  65.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  33.13 
 
 
275 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  30.93 
 
 
2392 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  32.98 
 
 
1518 aa  62.4  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  35.16 
 
 
355 aa  61.6  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  28.08 
 
 
476 aa  62  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  29.32 
 
 
1732 aa  60.8  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  34.07 
 
 
842 aa  60.8  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  27.36 
 
 
1842 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  28.46 
 
 
1247 aa  58.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  25 
 
 
460 aa  57  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
589 aa  54.7  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  33.33 
 
 
1055 aa  54.7  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  32.71 
 
 
380 aa  54.3  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  25.69 
 
 
456 aa  54.3  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  29.73 
 
 
270 aa  53.9  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  26.21 
 
 
271 aa  52.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  25 
 
 
458 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  27.37 
 
 
730 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
399 aa  51.6  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  40.79 
 
 
203 aa  50.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  29.13 
 
 
293 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  23.87 
 
 
2495 aa  48.9  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  28.07 
 
 
237 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  30.3 
 
 
290 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  46 
 
 
460 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0571  hypothetical protein  73.53 
 
 
760 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.137635  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  28.07 
 
 
538 aa  45.1  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>