45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1443 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  37.55 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  36.92 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  31.1 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  31.73 
 
 		 395 aa  105  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  28.98 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  32.21 
 
 		 1882 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  31.78 
 
 		 434 aa  87  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  39.01 
 
 		 1842 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 589 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  35.97 
 
 		 1052 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  30.16 
 
 		 1518 aa  79.7  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  33.33 
 
 		 2392 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  33.78 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  37.19 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  28.57 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  36.49 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  33.88 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  34.85 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  30.12 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  30.45 
 
 		 2495 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  34.71 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  34.21 
 
 		 460 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  34.51 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  28.1 
 
 		 1732 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1247 aa  62  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  32.59 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  27.33 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1331 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1055 aa  58.9  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  25.43 
 
 		 730 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  27.01 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0939  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1323 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.552149  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  24.73 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  26.12 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  24.44 
 
 		 286 aa  49.7  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  26.11 
 
 		 458 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0698  phage prohead protease, HK97 family  34.62 
 
 		 734 aa  46.2  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  30 
 
 		 538 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  36.26 
 
 		 1017 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  34.17 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  26.67 
 
 		 313 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  25.15 
 
 		 506 aa  43.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>