50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0497 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0497  FNIP  100 
 
 
456 aa  883    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  47.94 
 
 
399 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  45.52 
 
 
589 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  52.46 
 
 
352 aa  295  1e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  47.73 
 
 
1882 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  48.32 
 
 
290 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  32.82 
 
 
2495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  44.39 
 
 
293 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  47.93 
 
 
237 aa  179  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  44.56 
 
 
395 aa  172  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  43.28 
 
 
1052 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  31.7 
 
 
460 aa  149  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  26.53 
 
 
1055 aa  147  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  55.4 
 
 
203 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  45.76 
 
 
1842 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  29.17 
 
 
1732 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  29.46 
 
 
538 aa  121  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  33.08 
 
 
458 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  27.34 
 
 
1518 aa  118  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  55.66 
 
 
269 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  26.76 
 
 
730 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  37.85 
 
 
2392 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  28.37 
 
 
476 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  32.13 
 
 
355 aa  90.5  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  29.24 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  32.56 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  33.64 
 
 
1017 aa  76.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  24.51 
 
 
1118 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  30.19 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  29.84 
 
 
269 aa  63.9  0.000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  35.43 
 
 
313 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  24.43 
 
 
1247 aa  60.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0223  hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  60.1  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.304075  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  29.79 
 
 
361 aa  57  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  22.22 
 
 
380 aa  56.6  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  31.51 
 
 
297 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  22.08 
 
 
1331 aa  54.3  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  25.69 
 
 
657 aa  54.3  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  26.27 
 
 
691 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  15 
 
 
1266 aa  49.3  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  26.79 
 
 
270 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  25.15 
 
 
271 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  35.16 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  25.53 
 
 
275 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  19.13 
 
 
523 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  26.35 
 
 
158 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  30.59 
 
 
213 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0939  hypothetical protein  23.47 
 
 
1323 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.552149  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  25.74 
 
 
1041 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>