42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p320_02 on replicon NC_011314
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  47.93 
 
 		 456 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  51.48 
 
 		 399 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  45.21 
 
 		 589 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  51.7 
 
 		 352 aa  159  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  44.55 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  42 
 
 		 293 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  44.31 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  35.66 
 
 		 1842 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  53.4 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  35.88 
 
 		 2495 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  31.62 
 
 		 395 aa  99  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  45.86 
 
 		 1882 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  32.21 
 
 		 1052 aa  93.6  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  26.07 
 
 		 1732 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  33.78 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1055 aa  75.5  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  33.1 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  31.12 
 
 		 476 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  33.33 
 
 		 1518 aa  71.6  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  31.11 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  26.96 
 
 		 2392 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  29.96 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  30.92 
 
 		 538 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  29.58 
 
 		 460 aa  65.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1726  subtilisin-like serine protease  32.23 
 
 		 1017 aa  65.5  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.916379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  27.04 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  30.56 
 
 		 730 aa  63.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  28.69 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0698  phage prohead protease, HK97 family  28.42 
 
 		 734 aa  54.3  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  30.77 
 
 		 380 aa  52  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1247 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  30.19 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  26.15 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  28.07 
 
 		 657 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0223  hypothetical protein  41.67 
 
 		 109 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.304075  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1118 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  37.18 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1331 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  39.62 
 
 		 434 aa  42.4  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  31.31 
 
 		 297 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>