74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1988 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  100 
 
 
1732 aa  3480    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  56.7 
 
 
2392 aa  1807    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  30.39 
 
 
1882 aa  182  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  33.03 
 
 
1052 aa  176  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  27.96 
 
 
460 aa  171  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  48.19 
 
 
2031 aa  155  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  28.29 
 
 
1518 aa  153  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.09 
 
 
1842 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  35.44 
 
 
355 aa  150  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  31.31 
 
 
395 aa  142  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  28.3 
 
 
1247 aa  138  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  30.48 
 
 
456 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  25.59 
 
 
458 aa  120  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1972  hypothetical protein  89.47 
 
 
1502 aa  114  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231233  hitchhiker  0.000116216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
399 aa  113  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  23.34 
 
 
730 aa  106  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  24.56 
 
 
476 aa  107  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  36.46 
 
 
361 aa  105  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  26.69 
 
 
352 aa  103  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  23.8 
 
 
2495 aa  97.1  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1450  hypothetical protein  28.68 
 
 
848 aa  93.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.339438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  72.73 
 
 
1143 aa  90.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  30.81 
 
 
320 aa  88.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  66.67 
 
 
484 aa  87.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  58.73 
 
 
834 aa  87.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
589 aa  87  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  27.94 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  22.7 
 
 
1118 aa  84  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  26.07 
 
 
237 aa  77.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  34.57 
 
 
967 aa  77  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  36.11 
 
 
203 aa  75.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  59.62 
 
 
556 aa  74.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  33.78 
 
 
290 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2735  surface antigen, putative  31.43 
 
 
460 aa  74.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000450134  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  31.3 
 
 
293 aa  73.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  34.51 
 
 
987 aa  72  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1977  hypothetical protein  48.39 
 
 
875 aa  69.3  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00338122  hitchhiker  0.000166946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  28.29 
 
 
691 aa  67  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  25.12 
 
 
313 aa  66.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3983  hypothetical protein  27.85 
 
 
382 aa  65.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453409  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  21.32 
 
 
1055 aa  65.5  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  31.01 
 
 
434 aa  64.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  28.1 
 
 
254 aa  63.2  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  33.94 
 
 
269 aa  62.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  31.69 
 
 
225 aa  62.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  34.3 
 
 
437 aa  61.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  29.32 
 
 
657 aa  60.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  27.43 
 
 
278 aa  60.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  37.97 
 
 
297 aa  61.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  27.61 
 
 
271 aa  60.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  29.17 
 
 
231 aa  58.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  26.22 
 
 
270 aa  57.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  28.49 
 
 
380 aa  57  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  33.72 
 
 
158 aa  56.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  45.12 
 
 
1732 aa  56.2  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  31.96 
 
 
1013 aa  56.2  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  24.82 
 
 
713 aa  54.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  33.77 
 
 
1009 aa  53.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  34.32 
 
 
1821 aa  52.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  28.68 
 
 
506 aa  52.8  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1895  subtilisin-like serine protease  23.28 
 
 
538 aa  52.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  39.51 
 
 
570 aa  52  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  26.47 
 
 
710 aa  51.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  37.93 
 
 
1126 aa  51.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  21.21 
 
 
275 aa  51.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  30.84 
 
 
1041 aa  50.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  36.71 
 
 
1831 aa  49.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  29.2 
 
 
414 aa  49.3  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2737  hypothetical protein  30.32 
 
 
246 aa  49.3  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000267628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0169  hypothetical protein  38.54 
 
 
629 aa  48.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  34.74 
 
 
1672 aa  47.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  38.6 
 
 
286 aa  47  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  36.73 
 
 
2296 aa  47  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  21.47 
 
 
1168 aa  46.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>