17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1992 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1992  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  225  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375706  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  41.03 
 
 
361 aa  75.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2180  hypothetical protein  40 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.123938  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  33.01 
 
 
313 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  32.79 
 
 
1882 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  32.35 
 
 
506 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  36.73 
 
 
225 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  38.46 
 
 
1518 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  29.07 
 
 
460 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  30.14 
 
 
1247 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  41.46 
 
 
355 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  38.6 
 
 
285 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  31.82 
 
 
2392 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  29.67 
 
 
395 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  40 
 
 
1732 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  28.26 
 
 
278 aa  40.4  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  33.33 
 
 
1842 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>