42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1958 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  100 
 
 		 458 aa  924    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  39.75 
 
 		 1882 aa  212  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1052 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  37.83 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.62 
 
 		 1842 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  29.01 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  26.88 
 
 		 1518 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  25.59 
 
 		 1732 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  33.08 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  33.25 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  31.57 
 
 		 589 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  29.11 
 
 		 355 aa  106  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  25.2 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  25.46 
 
 		 730 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  27.16 
 
 		 2392 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  26.61 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  35.02 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  34.33 
 
 		 293 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1247 aa  76.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  25.38 
 
 		 691 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  27.24 
 
 		 285 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  26.55 
 
 		 320 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  32.1 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  29.96 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  36.43 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  41.1 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  26.29 
 
 		 2495 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  33.33 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1055 aa  55.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  30.05 
 
 		 203 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  40.91 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  25.73 
 
 		 225 aa  53.5  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  25 
 
 		 657 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  24.02 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1331 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0939  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1323 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.552149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  37.21 
 
 		 2031 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  26.11 
 
 		 254 aa  47  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  39.68 
 
 		 270 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  36.25 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  36.51 
 
 		 271 aa  43.5  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>