62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1995 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1401    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  29.35 
 
 		 1882 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.25 
 
 		 4855 aa  105  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  31.91 
 
 		 476 aa  104  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  37.26 
 
 		 1467 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2216  hypothetical protein  34.89 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0273004 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  35.68 
 
 		 1937 aa  101  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  40 
 
 		 1013 aa  98.2  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  35.35 
 
 		 1672 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  37.57 
 
 		 3333 aa  89  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1052 aa  87  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  29.25 
 
 		 460 aa  87  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  24.62 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  28.04 
 
 		 1842 aa  82  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  29.38 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.91 
 
 		 2744 aa  81.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  29.86 
 
 		 2716 aa  79.7  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1977 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  35.74 
 
 		 741 aa  77.4  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  31.15 
 
 		 1419 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  25.38 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  29.79 
 
 		 730 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  26.9 
 
 		 1518 aa  72  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.51 
 
 		 759 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  28.67 
 
 		 657 aa  69.7  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  30.34 
 
 		 361 aa  69.7  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  31.67 
 
 		 2495 aa  68.2  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  43.18 
 
 		 454 aa  67  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  28.29 
 
 		 1732 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  30.7 
 
 		 352 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  28.68 
 
 		 2392 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  35 
 
 		 1247 aa  65.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  35 
 
 		 1331 aa  63.9  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0939  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1323 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.552149  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  27.35 
 
 		 2267 aa  60.8  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3373  GLUG domain protein  26.97 
 
 		 578 aa  60.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  35.24 
 
 		 285 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.93 
 
 		 1137 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.21 
 
 		 1081 aa  58.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.24 
 
 		 808 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  30.18 
 
 		 715 aa  55.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  34.69 
 
 		 380 aa  55.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  30.21 
 
 		 313 aa  53.5  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 589 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  27.43 
 
 		 456 aa  51.6  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  29.08 
 
 		 1855 aa  51.2  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  27.1 
 
 		 434 aa  50.8  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.16 
 
 		 1004 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0804  hypothetical protein  36.09 
 
 		 405 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000115275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  33.82 
 
 		 1018 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  29.3 
 
 		 991 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  32.33 
 
 		 1009 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  27.97 
 
 		 1058 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  36.63 
 
 		 1181 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1055 aa  46.2  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  33.66 
 
 		 293 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  25.71 
 
 		 290 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  33 
 
 		 254 aa  44.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  31.88 
 
 		 269 aa  43.9  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.4 
 
 		 4500 aa  43.9  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>