16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2216 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2216  hypothetical protein  100 
 
 
576 aa  1185    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0273004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  34.89 
 
 
691 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  27.78 
 
 
1977 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.12 
 
 
2744 aa  62.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  27.92 
 
 
2716 aa  59.3  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  26.87 
 
 
1467 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.6 
 
 
4855 aa  57  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  37.33 
 
 
1013 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  26.07 
 
 
3333 aa  50.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.53 
 
 
1148 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  37.93 
 
 
454 aa  47.8  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  29.03 
 
 
1937 aa  45.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.13 
 
 
759 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  23.93 
 
 
1672 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  35.21 
 
 
2267 aa  43.9  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  33.33 
 
 
741 aa  43.9  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>