68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1008 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1008  GLUG  100 
 
 
1013 aa  1989    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  89.27 
 
 
390 aa  354  5e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  77.14 
 
 
1169 aa  308  3e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  35.63 
 
 
1419 aa  264  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.27 
 
 
1081 aa  261  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  33.65 
 
 
1058 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  37.45 
 
 
3333 aa  226  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.76 
 
 
4855 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.96 
 
 
2387 aa  211  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.21 
 
 
2744 aa  204  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  32.35 
 
 
2334 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  31.16 
 
 
1003 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.12 
 
 
4500 aa  195  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.79 
 
 
1137 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.23 
 
 
1148 aa  190  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  28.69 
 
 
1009 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.9 
 
 
985 aa  188  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.3 
 
 
1004 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  29.53 
 
 
991 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  31.69 
 
 
2328 aa  177  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  35.46 
 
 
454 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  30.19 
 
 
2716 aa  175  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  41.79 
 
 
1467 aa  172  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  30.46 
 
 
1018 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  34.64 
 
 
770 aa  159  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  39.79 
 
 
1937 aa  151  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  41.95 
 
 
2079 aa  148  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.4 
 
 
800 aa  145  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.92 
 
 
1105 aa  142  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  29.27 
 
 
1977 aa  140  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  42.94 
 
 
1417 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.94 
 
 
3589 aa  133  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.86 
 
 
4016 aa  128  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  37.1 
 
 
1451 aa  127  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  40.84 
 
 
1447 aa  127  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.89 
 
 
759 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  41.48 
 
 
1371 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.57 
 
 
5613 aa  110  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.74 
 
 
3132 aa  106  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  30.92 
 
 
1999 aa  102  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.9 
 
 
2217 aa  100  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  40 
 
 
691 aa  99.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  27.83 
 
 
715 aa  99  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.83 
 
 
2054 aa  99  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  31.7 
 
 
741 aa  98.2  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  32.84 
 
 
1910 aa  96.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3373  GLUG domain protein  29.81 
 
 
578 aa  94  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.49 
 
 
2834 aa  94.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  32.84 
 
 
1994 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.82 
 
 
2887 aa  91.7  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  29.51 
 
 
2267 aa  91.3  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.67 
 
 
1637 aa  90.9  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  34.29 
 
 
2271 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  27.74 
 
 
1672 aa  87.8  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  33.2 
 
 
1064 aa  85.5  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.11 
 
 
481 aa  82.8  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.2 
 
 
808 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  35.09 
 
 
1691 aa  69.7  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.37 
 
 
956 aa  67  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.79 
 
 
1844 aa  65.1  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
1855 aa  60.1  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  35.29 
 
 
1181 aa  57.4  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.26 
 
 
1741 aa  55.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_002950  PG2216  hypothetical protein  37.33 
 
 
576 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0273004 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.05 
 
 
607 aa  47.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  26.03 
 
 
1143 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.12 
 
 
3340 aa  45.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  27.56 
 
 
268 aa  44.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>