46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2080 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  100 
 
 
3333 aa  6464    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.51 
 
 
4855 aa  361  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  32.48 
 
 
1977 aa  324  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  29.65 
 
 
1937 aa  246  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  33.85 
 
 
1467 aa  244  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  37.45 
 
 
1013 aa  226  7e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.38 
 
 
2744 aa  190  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  50.67 
 
 
2716 aa  180  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  34.75 
 
 
1064 aa  162  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  34.31 
 
 
741 aa  146  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  41.6 
 
 
1419 aa  133  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  32.4 
 
 
1672 aa  130  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3373  GLUG domain protein  37.31 
 
 
578 aa  128  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  39.65 
 
 
2267 aa  124  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.27 
 
 
1148 aa  124  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.86 
 
 
759 aa  120  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.56 
 
 
1137 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.97 
 
 
1637 aa  100  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  30.22 
 
 
1417 aa  100  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  32.75 
 
 
1009 aa  99.8  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.98 
 
 
808 aa  99  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  29.48 
 
 
991 aa  96.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  35.32 
 
 
691 aa  96.3  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  31.71 
 
 
1003 aa  94  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  32.9 
 
 
1018 aa  91.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  31.34 
 
 
715 aa  89.4  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  43.12 
 
 
454 aa  88.2  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  31.55 
 
 
1058 aa  88.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.68 
 
 
1004 aa  87.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.25 
 
 
985 aa  85.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.47 
 
 
2387 aa  83.6  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  29.85 
 
 
3562 aa  82.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.71 
 
 
1081 aa  82.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1547  hypothetical protein  32.65 
 
 
1181 aa  77.4  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  28.32 
 
 
1787 aa  73.9  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  29.75 
 
 
2328 aa  70.5  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3394  metallophosphoesterase  25.13 
 
 
1855 aa  70.1  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.83 
 
 
4500 aa  63.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  30.04 
 
 
2334 aa  56.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.84 
 
 
607 aa  55.5  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  26.15 
 
 
4689 aa  52.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  28.79 
 
 
6211 aa  52  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2216  hypothetical protein  26.07 
 
 
576 aa  50.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0273004 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  25.47 
 
 
5123 aa  50.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  27.8 
 
 
1143 aa  49.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  28.94 
 
 
1141 aa  47.8  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>