108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2461 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
1637 aa  3148    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  35.47 
 
 
2716 aa  344  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.32 
 
 
2744 aa  311  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.32 
 
 
4855 aa  304  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.05 
 
 
1105 aa  256  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  39.6 
 
 
2271 aa  236  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  39.35 
 
 
1994 aa  233  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  34.77 
 
 
1451 aa  226  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  35.37 
 
 
1447 aa  225  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.71 
 
 
3589 aa  220  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.68 
 
 
956 aa  210  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  33.27 
 
 
1910 aa  198  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.47 
 
 
5613 aa  194  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  44.06 
 
 
1417 aa  194  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.02 
 
 
2054 aa  194  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.51 
 
 
4016 aa  194  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  34.4 
 
 
1999 aa  193  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.12 
 
 
3132 aa  193  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  39.13 
 
 
2328 aa  192  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.58 
 
 
2387 aa  192  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  38.16 
 
 
2334 aa  191  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  34.48 
 
 
1691 aa  189  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.17 
 
 
2887 aa  185  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  35.5 
 
 
1371 aa  184  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.32 
 
 
800 aa  184  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  40.87 
 
 
1419 aa  182  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  40.77 
 
 
770 aa  177  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  38.41 
 
 
1058 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.71 
 
 
985 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.13 
 
 
1148 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  39.86 
 
 
991 aa  176  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.08 
 
 
607 aa  175  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  40.82 
 
 
1003 aa  172  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  40.68 
 
 
1009 aa  172  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.29 
 
 
2834 aa  171  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.91 
 
 
1137 aa  170  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  41.54 
 
 
1018 aa  168  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  38.31 
 
 
390 aa  166  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  35.51 
 
 
1169 aa  161  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.41 
 
 
2217 aa  152  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  36.86 
 
 
2079 aa  151  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35 
 
 
4500 aa  150  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.48 
 
 
481 aa  146  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.66 
 
 
3535 aa  131  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.2 
 
 
3419 aa  131  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.17 
 
 
3537 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.68 
 
 
3298 aa  130  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.16 
 
 
3299 aa  130  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.77 
 
 
2637 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.28 
 
 
1844 aa  118  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  34.2 
 
 
3299 aa  115  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  30.13 
 
 
3333 aa  110  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  39.81 
 
 
1467 aa  108  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  36.26 
 
 
1013 aa  102  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.46 
 
 
1650 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.67 
 
 
3340 aa  99.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  25.88 
 
 
2679 aa  98.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  35.32 
 
 
715 aa  92  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40 
 
 
808 aa  92  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  43.62 
 
 
3349 aa  91.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.88 
 
 
759 aa  90.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.98 
 
 
1004 aa  89.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  31.06 
 
 
1741 aa  87.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.26 
 
 
1772 aa  85.1  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  33.72 
 
 
4135 aa  81.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  37.25 
 
 
1937 aa  80.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  33.33 
 
 
4007 aa  77.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  32.1 
 
 
4177 aa  75.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  32.72 
 
 
4184 aa  75.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  32.66 
 
 
1672 aa  75.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0211  hypothetical protein  37.66 
 
 
741 aa  73.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.552995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  27.69 
 
 
4347 aa  73.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  30.12 
 
 
4170 aa  72.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.98 
 
 
946 aa  71.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.55 
 
 
2296 aa  70.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.54 
 
 
4132 aa  69.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  26.64 
 
 
4435 aa  68.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.37 
 
 
1081 aa  67  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.38 
 
 
2927 aa  65.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  30.99 
 
 
4030 aa  65.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  33.17 
 
 
3920 aa  63.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  30 
 
 
3409 aa  64.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  28.57 
 
 
4009 aa  64.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3373  GLUG domain protein  31.49 
 
 
578 aa  62.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  30.41 
 
 
4049 aa  62.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  28.14 
 
 
3472 aa  61.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  38.46 
 
 
1275 aa  61.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.87 
 
 
4219 aa  60.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  22.76 
 
 
3332 aa  57.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  26.27 
 
 
4283 aa  56.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2866  GLUG domain protein  33.33 
 
 
2267 aa  55.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  26.82 
 
 
1977 aa  55.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  30.85 
 
 
1064 aa  55.5  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0529  putative periplasmic protein  33.33 
 
 
553 aa  54.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.935894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1743  putative periplasmic protein  33.33 
 
 
553 aa  54.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.38 
 
 
1570 aa  52.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  31.21 
 
 
1526 aa  51.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0747  GLUG  33.92 
 
 
454 aa  50.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.120548  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  29.94 
 
 
1085 aa  49.3  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 
1349 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>