86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1057 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  100 
 
 
1787 aa  3451    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0015  hypothetical protein  29.29 
 
 
1073 aa  173  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2158  hypothetical protein  44.44 
 
 
1808 aa  115  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  31.25 
 
 
5080 aa  111  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0007  putative lipoprotein  26.4 
 
 
981 aa  103  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.949934  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  32.64 
 
 
1538 aa  94  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0230  hypothetical protein  40.91 
 
 
657 aa  88.2  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.924729  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0016  hypothetical protein  28.87 
 
 
468 aa  84  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  27.18 
 
 
2456 aa  75.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  29.22 
 
 
3333 aa  76.3  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  28.49 
 
 
5559 aa  74.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.01 
 
 
4106 aa  74.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
5171 aa  72  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  30.99 
 
 
4689 aa  71.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.87 
 
 
3586 aa  70.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  28.7 
 
 
2625 aa  68.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  38.18 
 
 
1141 aa  66.2  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  28.86 
 
 
2704 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.48 
 
 
3739 aa  65.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  29.07 
 
 
3314 aa  64.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  27.94 
 
 
5561 aa  63.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  27.5 
 
 
5561 aa  64.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  29.8 
 
 
3824 aa  63.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  29.48 
 
 
3824 aa  63.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  29.61 
 
 
3824 aa  63.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.18 
 
 
1586 aa  62.8  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  27.32 
 
 
5559 aa  62.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  32.06 
 
 
3562 aa  62  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  39.45 
 
 
1350 aa  61.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.58 
 
 
2927 aa  61.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  29.29 
 
 
3721 aa  60.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.66 
 
 
1279 aa  59.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  26.4 
 
 
1217 aa  58.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  27.06 
 
 
5561 aa  57.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  34.78 
 
 
4430 aa  58.2  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1525  rhizobiocin/RTX toxin  31.98 
 
 
301 aa  56.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0568  hypothetical protein  26.87 
 
 
1766 aa  56.6  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  36.7 
 
 
2524 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  28.42 
 
 
4214 aa  55.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0010  hypothetical protein  38.3 
 
 
178 aa  54.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  35.54 
 
 
2542 aa  54.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  27.53 
 
 
4334 aa  54.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  33.61 
 
 
1864 aa  54.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  27.1 
 
 
5451 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  36.94 
 
 
9030 aa  53.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  36.94 
 
 
8682 aa  53.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  26.96 
 
 
2802 aa  53.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  36.7 
 
 
4678 aa  52.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  33.91 
 
 
2887 aa  52.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  27.38 
 
 
8064 aa  52.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3869  Ca 2+ binding protein  25.25 
 
 
1572 aa  52.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  33.24 
 
 
2667 aa  52.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  33.45 
 
 
1287 aa  52.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  24.42 
 
 
2193 aa  52.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  28.21 
 
 
3925 aa  52.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  26.14 
 
 
1079 aa  52  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  27.79 
 
 
946 aa  52  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  34.09 
 
 
1566 aa  50.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  28.79 
 
 
1096 aa  51.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  29.59 
 
 
357 aa  51.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  33.04 
 
 
6662 aa  51.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.26 
 
 
3552 aa  51.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.04 
 
 
6683 aa  51.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41316  predicted protein  22.87 
 
 
380 aa  50.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  30.04 
 
 
6310 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  34.62 
 
 
4854 aa  50.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  29.07 
 
 
639 aa  50.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  33.96 
 
 
6753 aa  50.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.74 
 
 
5962 aa  49.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  33.04 
 
 
6779 aa  49.7  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  25.94 
 
 
1421 aa  48.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  27.56 
 
 
1112 aa  48.9  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1054  hypothetical protein  27.06 
 
 
527 aa  48.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01251  hypothetical protein  28.21 
 
 
531 aa  48.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.430243 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20961  hemolysin-type calcium-binding domain-containing protein  31.36 
 
 
2082 aa  48.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  36.05 
 
 
1439 aa  48.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  28.85 
 
 
2552 aa  47.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  24.21 
 
 
14829 aa  48.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
5218 aa  46.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  26.69 
 
 
3923 aa  46.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  27.57 
 
 
1301 aa  46.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  27.7 
 
 
820 aa  46.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  30.82 
 
 
1855 aa  46.2  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  25.65 
 
 
1424 aa  45.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0112  hypothetical protein  24.94 
 
 
677 aa  45.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0954339  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.2 
 
 
2245 aa  45.4  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>