129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1289 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  55.29 
 
 		 1003 aa  898    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 		 985 aa  1882    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  47.18 
 
 		 1009 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.08 
 
 		 1148 aa  706    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  46.65 
 
 		 991 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.2 
 
 		 1004 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  61.22 
 
 		 1137 aa  1004    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  46.13 
 
 		 1018 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  38.12 
 
 		 1419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  56.98 
 
 		 1417 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.82 
 
 		 1081 aa  362  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.24 
 
 		 2387 aa  354  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  35.33 
 
 		 1058 aa  341  5e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  35.58 
 
 		 2334 aa  329  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.37 
 
 		 4500 aa  307  6e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  54.34 
 
 		 2716 aa  298  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  41.65 
 
 		 770 aa  297  7e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  41.97 
 
 		 2079 aa  291  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42 
 
 		 800 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  38.05 
 
 		 2328 aa  281  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.52 
 
 		 1105 aa  281  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.5 
 
 		 607 aa  260  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  45.1 
 
 		 1447 aa  257  6e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  44.81 
 
 		 1451 aa  255  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.99 
 
 		 4016 aa  248  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  43.25 
 
 		 390 aa  239  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.54 
 
 		 5613 aa  238  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  46.74 
 
 		 1999 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.95 
 
 		 3589 aa  224  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  42.41 
 
 		 1169 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.69 
 
 		 3132 aa  209  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  32.66 
 
 		 1013 aa  206  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  42.76 
 
 		 1371 aa  199  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  39.27 
 
 		 1994 aa  195  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  39.58 
 
 		 2271 aa  192  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  34.68 
 
 		 1910 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.68 
 
 		 2054 aa  190  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.74 
 
 		 2834 aa  184  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.36 
 
 		 2887 aa  183  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.33 
 
 		 4855 aa  183  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.02 
 
 		 481 aa  179  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  43.58 
 
 		 1691 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.1 
 
 		 2217 aa  172  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.6 
 
 		 2744 aa  162  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.67 
 
 		 1637 aa  159  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.97 
 
 		 1844 aa  157  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.61 
 
 		 956 aa  144  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.02 
 
 		 1741 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.07 
 
 		 759 aa  135  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.24 
 
 		 808 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  30 
 
 		 715 aa  128  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  40.8 
 
 		 2679 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  33.07 
 
 		 3349 aa  110  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  27.78 
 
 		 3299 aa  107  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.14 
 
 		 3340 aa  107  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  35.14 
 
 		 4049 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  31.48 
 
 		 4177 aa  99  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  32.61 
 
 		 4170 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  39.2 
 
 		 4132 aa  95.9  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  31.87 
 
 		 4135 aa  95.9  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  34.3 
 
 		 3472 aa  95.1  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  30.22 
 
 		 4347 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  31.15 
 
 		 4184 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  35.03 
 
 		 4007 aa  91.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2080  GLUG domain protein  33.02 
 
 		 3333 aa  90.9  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  31.93 
 
 		 4009 aa  90.9  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  30.94 
 
 		 4030 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  30.68 
 
 		 3409 aa  84  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  40.08 
 
 		 1467 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  28.95 
 
 		 3332 aa  79  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.02 
 
 		 946 aa  78.2  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  31.5 
 
 		 4435 aa  76.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2338  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1977 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  43.09 
 
 		 1672 aa  64.7  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  41.94 
 
 		 122 aa  63.9  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4181  filamentous haemagglutinin-like protein  36.54 
 
 		 759 aa  63.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153742 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  44.35 
 
 		 1937 aa  62.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2352  filamentous haemagglutinin-like protein  28.95 
 
 		 820 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2349  filamentous haemagglutinin-like protein  35.71 
 
 		 804 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3373  GLUG domain protein  31.58 
 
 		 578 aa  58.9  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0529  putative periplasmic protein  33.85 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.935894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1743  putative periplasmic protein  33.85 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2353  filamentous haemagglutinin-like protein  41.11 
 
 		 824 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2530  filamentous haemagglutinin-like protein  41.98 
 
 		 776 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.957928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.72 
 
 		 1349 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4131  filamentous haemagglutinin-like protein  26.2 
 
 		 848 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343736  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5640  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.67 
 
 		 822 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00258784 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5479  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.14 
 
 		 816 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.3 
 
 		 1650 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3442  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.47 
 
 		 952 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0285  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.44 
 
 		 1202 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2674  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  31.47 
 
 		 952 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.47 
 
 		 2637 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.25 
 
 		 1391 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1759  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.67 
 
 		 758 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2350  filamentous haemagglutinin-like protein  40 
 
 		 816 aa  55.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.883366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.15 
 
 		 3419 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1390  filamentous haemagglutinin-like protein  26.35 
 
 		 1033 aa  55.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.379495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.85 
 
 		 1570 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.39 
 
 		 3535 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>