77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0355 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  33.72 
 
 		 3349 aa  1314    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  31.01 
 
 		 3332 aa  1192    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  100 
 
 		 3472 aa  6862    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  53.84 
 
 		 3409 aa  3247    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  26.65 
 
 		 3299 aa  582  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  27.28 
 
 		 4177 aa  574  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  27.43 
 
 		 4184 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.62 
 
 		 3340 aa  563  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  27.33 
 
 		 4170 aa  547  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  28.56 
 
 		 4135 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  27.2 
 
 		 4007 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  26.86 
 
 		 4132 aa  455  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  31.49 
 
 		 4283 aa  327  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  27.39 
 
 		 4009 aa  295  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  26.98 
 
 		 4347 aa  283  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  26.95 
 
 		 4049 aa  275  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.15 
 
 		 4219 aa  251  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  28.6 
 
 		 4030 aa  246  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  25.5 
 
 		 4435 aa  233  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.8 
 
 		 5613 aa  110  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  33.43 
 
 		 2079 aa  110  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.11 
 
 		 985 aa  102  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.07 
 
 		 1105 aa  102  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.23 
 
 		 4500 aa  100  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 		 1137 aa  100  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  35.02 
 
 		 770 aa  99.4  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  32.08 
 
 		 1003 aa  95.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  30.26 
 
 		 1451 aa  92.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  32.93 
 
 		 1417 aa  92.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.18 
 
 		 4016 aa  92.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  31.58 
 
 		 1447 aa  92.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  36.2 
 
 		 1018 aa  90.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.39 
 
 		 1081 aa  90.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  32.34 
 
 		 2716 aa  89.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.1 
 
 		 607 aa  89  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.19 
 
 		 2387 aa  88.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  35.32 
 
 		 1058 aa  89  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  36.11 
 
 		 2328 aa  89  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  39.46 
 
 		 2334 aa  87.8  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  30.77 
 
 		 1009 aa  84.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.23 
 
 		 2054 aa  84.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.84 
 
 		 1004 aa  84.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.29 
 
 		 956 aa  84.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.71 
 
 		 2887 aa  83.2  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.62 
 
 		 2217 aa  82  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  29.05 
 
 		 1910 aa  81.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.28 
 
 		 1148 aa  81.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.93 
 
 		 3132 aa  81.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  31.98 
 
 		 2271 aa  81.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1994 aa  81.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.97 
 
 		 2744 aa  80.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.63 
 
 		 4855 aa  80.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  31.02 
 
 		 1419 aa  77.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.05 
 
 		 1844 aa  77.4  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.15 
 
 		 3589 aa  77.8  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  31.35 
 
 		 991 aa  77  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.64 
 
 		 800 aa  74.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  31.5 
 
 		 1999 aa  70.9  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.93 
 
 		 481 aa  69.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  32.07 
 
 		 2679 aa  69.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.5 
 
 		 2834 aa  66.6  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  29.86 
 
 		 1169 aa  64.7  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  31.41 
 
 		 1371 aa  64.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  29.25 
 
 		 390 aa  62.8  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.14 
 
 		 1637 aa  60.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.45 
 
 		 759 aa  57  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  30.22 
 
 		 715 aa  55.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.3 
 
 		 808 aa  53.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.77 
 
 		 1691 aa  52.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  30.73 
 
 		 1741 aa  52  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.77 
 
 		 3785 aa  51.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  29.41 
 
 		 3131 aa  49.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  28.25 
 
 		 3552 aa  49.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30 
 
 		 1650 aa  48.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  28.89 
 
 		 3144 aa  47.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  29.04 
 
 		 3141 aa  47  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  29.63 
 
 		 3501 aa  47  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>