74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1458 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.93 
 
 
3340 aa  1610    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  100 
 
 
3299 aa  6562    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  26.54 
 
 
3332 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  26.59 
 
 
3472 aa  561  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  28.2 
 
 
3349 aa  496  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  28.17 
 
 
3409 aa  296  7e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  25.72 
 
 
4007 aa  238  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  28.84 
 
 
4135 aa  226  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  27.87 
 
 
4177 aa  209  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  27.28 
 
 
4170 aa  201  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  27.54 
 
 
4184 aa  197  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  25.92 
 
 
4132 aa  196  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  27.02 
 
 
4009 aa  192  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  27.2 
 
 
4347 aa  189  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  27.89 
 
 
4049 aa  178  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  28.78 
 
 
4283 aa  171  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.1 
 
 
4219 aa  169  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  26.26 
 
 
4030 aa  165  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  35.55 
 
 
1451 aa  135  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  35.16 
 
 
1447 aa  132  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  37.5 
 
 
2716 aa  132  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.38 
 
 
956 aa  128  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  33.46 
 
 
770 aa  119  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.91 
 
 
1148 aa  119  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  33.07 
 
 
991 aa  117  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  35.86 
 
 
2334 aa  117  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.55 
 
 
1004 aa  117  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  35.83 
 
 
1018 aa  115  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  26.08 
 
 
4435 aa  114  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.46 
 
 
3589 aa  113  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.44 
 
 
1637 aa  112  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.43 
 
 
4500 aa  111  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  37.22 
 
 
2328 aa  110  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.82 
 
 
2887 aa  110  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.31 
 
 
4016 aa  108  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.82 
 
 
3132 aa  108  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.38 
 
 
1105 aa  107  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.31 
 
 
985 aa  107  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 
800 aa  106  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.68 
 
 
2217 aa  105  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.84 
 
 
2744 aa  105  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.2 
 
 
2387 aa  104  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  31.68 
 
 
1419 aa  104  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  33.15 
 
 
1058 aa  103  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  25.66 
 
 
1009 aa  103  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  33.96 
 
 
2079 aa  103  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.18 
 
 
1137 aa  103  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  32.86 
 
 
1003 aa  103  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.81 
 
 
5613 aa  102  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  28.77 
 
 
1999 aa  101  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.22 
 
 
607 aa  100  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.7 
 
 
481 aa  100  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.57 
 
 
1081 aa  99  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  31.13 
 
 
1417 aa  96.3  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.17 
 
 
4855 aa  96.3  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.24 
 
 
2834 aa  94.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.67 
 
 
2054 aa  94.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  28.41 
 
 
1994 aa  90.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  29.6 
 
 
1169 aa  88.2  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  27.71 
 
 
2271 aa  87.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  29.02 
 
 
1691 aa  86.7  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  28.7 
 
 
1371 aa  85.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.69 
 
 
1844 aa  85.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.04 
 
 
1741 aa  84.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  27.96 
 
 
390 aa  82  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  29.69 
 
 
715 aa  78.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.89 
 
 
759 aa  75.1  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  29.01 
 
 
2679 aa  72.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.37 
 
 
808 aa  72  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.4 
 
 
946 aa  63.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.6 
 
 
1650 aa  53.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2359  hypothetical protein  41.67 
 
 
212 aa  48.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486627  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  26.45 
 
 
1085 aa  47  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2349  filamentous haemagglutinin-like protein  30 
 
 
804 aa  46.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>