76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2227 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.03 
 
 
3340 aa  740    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  33.31 
 
 
3409 aa  1345    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  31.82 
 
 
3332 aa  1199    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  33.53 
 
 
3472 aa  1336    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  100 
 
 
3349 aa  6612    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  29.23 
 
 
4283 aa  633  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  28.26 
 
 
4135 aa  587  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  27.3 
 
 
4170 aa  517  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  27.84 
 
 
4132 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  27.79 
 
 
3299 aa  500  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  27.22 
 
 
4007 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  27.75 
 
 
4177 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  28.1 
 
 
4435 aa  431  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  28.59 
 
 
4184 aa  426  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.11 
 
 
4219 aa  333  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  28.32 
 
 
4030 aa  313  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  27.73 
 
 
4347 aa  305  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  27.87 
 
 
4009 aa  275  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  26.33 
 
 
4049 aa  255  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.32 
 
 
5613 aa  125  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  34.64 
 
 
770 aa  125  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  28.97 
 
 
2334 aa  121  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.32 
 
 
1137 aa  121  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  32.99 
 
 
2716 aa  120  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.13 
 
 
3589 aa  120  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  36.08 
 
 
2079 aa  120  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.99 
 
 
1004 aa  120  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.45 
 
 
2217 aa  118  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.77 
 
 
1105 aa  118  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  33.01 
 
 
1447 aa  117  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.11 
 
 
800 aa  117  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.27 
 
 
956 aa  114  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  44.85 
 
 
1058 aa  114  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  46.22 
 
 
1003 aa  113  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  31.83 
 
 
1451 aa  113  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  29.6 
 
 
2328 aa  113  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.08 
 
 
3132 aa  113  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  50.43 
 
 
1018 aa  113  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.72 
 
 
985 aa  111  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.65 
 
 
1081 aa  110  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  37.14 
 
 
1009 aa  109  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.54 
 
 
2387 aa  109  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.89 
 
 
2887 aa  107  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  32.36 
 
 
1910 aa  105  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.97 
 
 
481 aa  105  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.11 
 
 
607 aa  103  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32 
 
 
2054 aa  103  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  34.69 
 
 
1371 aa  103  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.75 
 
 
4500 aa  103  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  30.86 
 
 
1419 aa  103  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  32.03 
 
 
1999 aa  102  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.38 
 
 
4016 aa  102  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.8 
 
 
2834 aa  102  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  43.65 
 
 
390 aa  102  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  46.9 
 
 
1169 aa  102  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.03 
 
 
1148 aa  99.8  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  42.54 
 
 
1417 aa  99.8  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  32.34 
 
 
715 aa  97.1  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  40.35 
 
 
991 aa  96.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  38.41 
 
 
1994 aa  96.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  38.41 
 
 
2271 aa  95.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.13 
 
 
759 aa  94.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  43.86 
 
 
1691 aa  94  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  46.08 
 
 
2679 aa  94  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.42 
 
 
4855 aa  92.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.62 
 
 
1637 aa  90.9  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.86 
 
 
2744 aa  87.8  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.55 
 
 
808 aa  79  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.15 
 
 
946 aa  74.3  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.58 
 
 
1844 aa  72.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.17 
 
 
1741 aa  70.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  46.27 
 
 
122 aa  62.8  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1743  putative periplasmic protein  28.17 
 
 
553 aa  51.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0529  putative periplasmic protein  28.17 
 
 
553 aa  51.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.935894  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2359  hypothetical protein  40.35 
 
 
212 aa  48.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4181  filamentous haemagglutinin-like protein  32.1 
 
 
759 aa  47  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>