43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2359 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2359  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  417  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  55.77 
 
 
2079 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  47.62 
 
 
1058 aa  62.8  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  52 
 
 
2716 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  50 
 
 
2887 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  48.08 
 
 
1451 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.26 
 
 
607 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  44.26 
 
 
1169 aa  57  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  46.67 
 
 
2334 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  52.83 
 
 
1105 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  44.26 
 
 
390 aa  56.6  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.29 
 
 
4855 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  46.15 
 
 
1447 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  41.94 
 
 
122 aa  55.1  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.82 
 
 
1081 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.02 
 
 
481 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  51.72 
 
 
5613 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.45 
 
 
2744 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  42.11 
 
 
770 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  47.69 
 
 
1419 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  46.94 
 
 
2328 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.82 
 
 
1137 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.03 
 
 
4016 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.5 
 
 
4500 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  40 
 
 
3349 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.94 
 
 
759 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.27 
 
 
800 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  41.79 
 
 
1910 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  41.67 
 
 
3299 aa  48.5  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.4 
 
 
3589 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  29.09 
 
 
2271 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  35.19 
 
 
1994 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.3 
 
 
2054 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  44.68 
 
 
715 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.82 
 
 
2387 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48 
 
 
808 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  40 
 
 
1003 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  57.14 
 
 
1371 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.32 
 
 
985 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.46 
 
 
1637 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0760  hemagglutination domain-containing protein  42.62 
 
 
144 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.955622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.48 
 
 
3132 aa  41.6  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  41.82 
 
 
1018 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>