71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2997 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  100 
 
 		 4435 aa  8724    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  32.23 
 
 		 4283 aa  363  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.87 
 
 		 4219 aa  325  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  26.84 
 
 		 3409 aa  300  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  29.64 
 
 		 4135 aa  286  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  28.1 
 
 		 3349 aa  246  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  29.23 
 
 		 4007 aa  242  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  28.56 
 
 		 4347 aa  236  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  29.52 
 
 		 4049 aa  235  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  25.15 
 
 		 3472 aa  230  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  33.42 
 
 		 4030 aa  221  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  26.47 
 
 		 4132 aa  213  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  26.93 
 
 		 4009 aa  213  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  26.92 
 
 		 3332 aa  209  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  27.14 
 
 		 4170 aa  200  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  28.82 
 
 		 4184 aa  179  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  27.33 
 
 		 4177 aa  177  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.62 
 
 		 3340 aa  137  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  25.27 
 
 		 3299 aa  116  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.25 
 
 		 4500 aa  96.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  38.19 
 
 		 2334 aa  94.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  39.57 
 
 		 2328 aa  93.2  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.42 
 
 		 1081 aa  90.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  33.47 
 
 		 1417 aa  88.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.12 
 
 		 2217 aa  87.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.08 
 
 		 607 aa  87  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  34.93 
 
 		 1018 aa  87  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.01 
 
 		 3589 aa  85.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  32.92 
 
 		 1003 aa  84.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.56 
 
 		 1137 aa  84.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.88 
 
 		 1148 aa  84  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  50 
 
 		 5613 aa  83.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  43.48 
 
 		 1419 aa  82.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  44.76 
 
 		 991 aa  81.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  41.38 
 
 		 1009 aa  80.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.14 
 
 		 1004 aa  79.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.22 
 
 		 3132 aa  79  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  33.33 
 
 		 770 aa  79  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 		 1105 aa  78.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  43.36 
 
 		 1451 aa  77.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  32.16 
 
 		 2716 aa  77  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  32.09 
 
 		 1058 aa  76.3  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.19 
 
 		 2887 aa  76.3  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.5 
 
 		 985 aa  76.3  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  43.27 
 
 		 1447 aa  75.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.23 
 
 		 800 aa  75.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.16 
 
 		 2387 aa  74.7  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.28 
 
 		 946 aa  73.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.81 
 
 		 1844 aa  72.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.82 
 
 		 4016 aa  72  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  32.28 
 
 		 2079 aa  72  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.56 
 
 		 956 aa  71.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  49.33 
 
 		 1371 aa  68.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.63 
 
 		 4855 aa  68.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.05 
 
 		 481 aa  68.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.5 
 
 		 1637 aa  67.8  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  38.32 
 
 		 1691 aa  66.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  40.23 
 
 		 1169 aa  64.7  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.14 
 
 		 2744 aa  64.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  41.38 
 
 		 390 aa  64.3  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  36.54 
 
 		 2679 aa  63.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  28.2 
 
 		 715 aa  63.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.68 
 
 		 2834 aa  61.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  33.95 
 
 		 2271 aa  62  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1994 aa  60.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  38.04 
 
 		 1999 aa  60.1  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.86 
 
 		 2054 aa  59.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  29.71 
 
 		 1741 aa  58.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  27.54 
 
 		 1910 aa  57  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.51 
 
 		 759 aa  55.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.42 
 
 		 808 aa  51.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>