105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3312 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  95.55 
 
 
1910 aa  3157    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
2054 aa  4012    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.05 
 
 
3589 aa  325  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.07 
 
 
1105 aa  319  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  39.38 
 
 
1447 aa  294  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  38.25 
 
 
1451 aa  290  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.57 
 
 
4016 aa  286  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  37.32 
 
 
2716 aa  286  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  40.98 
 
 
1371 aa  281  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36 
 
 
2834 aa  251  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  34.43 
 
 
1999 aa  224  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.73 
 
 
4500 aa  221  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.54 
 
 
1137 aa  218  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  37.67 
 
 
1003 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.29 
 
 
985 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  31 
 
 
1009 aa  215  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.11 
 
 
1148 aa  215  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  37.37 
 
 
991 aa  209  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.21 
 
 
2744 aa  209  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  37.57 
 
 
2079 aa  204  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.92 
 
 
5613 aa  204  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  44.88 
 
 
1018 aa  200  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  38.44 
 
 
770 aa  199  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.97 
 
 
3132 aa  199  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.81 
 
 
956 aa  197  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  37.84 
 
 
1417 aa  197  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  40.46 
 
 
1419 aa  195  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.86 
 
 
1004 aa  195  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.59 
 
 
2217 aa  194  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  37.21 
 
 
1058 aa  194  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.9 
 
 
800 aa  192  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  35.26 
 
 
2271 aa  191  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.31 
 
 
607 aa  190  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  35.01 
 
 
1994 aa  189  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.82 
 
 
2387 aa  189  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  38.68 
 
 
2328 aa  181  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.87 
 
 
1081 aa  181  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  38.33 
 
 
2334 aa  179  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.49 
 
 
2887 aa  174  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.02 
 
 
1637 aa  163  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  36.27 
 
 
390 aa  162  8e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  37.98 
 
 
1691 aa  153  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  35.56 
 
 
1169 aa  152  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.88 
 
 
4855 aa  138  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.86 
 
 
481 aa  135  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.41 
 
 
2637 aa  132  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  28.32 
 
 
2679 aa  129  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.76 
 
 
3299 aa  124  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.64 
 
 
3537 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.98 
 
 
3419 aa  120  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  30 
 
 
1741 aa  118  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.55 
 
 
3535 aa  116  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.36 
 
 
3298 aa  116  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  31.62 
 
 
715 aa  104  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  32 
 
 
3349 aa  104  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.91 
 
 
1844 aa  102  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.91 
 
 
1650 aa  99.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  30.94 
 
 
1013 aa  99.4  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.78 
 
 
759 aa  95.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  28.36 
 
 
3299 aa  93.2  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  35.78 
 
 
4007 aa  90.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.24 
 
 
808 aa  90.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  34.67 
 
 
4049 aa  90.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  31.84 
 
 
4135 aa  90.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  29.88 
 
 
4347 aa  89.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  32.29 
 
 
4177 aa  86.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  33 
 
 
4030 aa  81.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.14 
 
 
3340 aa  81.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  31.98 
 
 
4009 aa  80.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  32.29 
 
 
4184 aa  80.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  26.52 
 
 
3332 aa  78.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  28.12 
 
 
3472 aa  78.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.73 
 
 
4132 aa  74.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  26.84 
 
 
3409 aa  73.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  30.43 
 
 
4170 aa  72.4  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3737  filamentous haemagglutinin-like protein  28.57 
 
 
805 aa  60.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.16 
 
 
1570 aa  60.1  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  41.86 
 
 
4435 aa  59.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.62 
 
 
946 aa  58.2  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2810  filamentous haemagglutinin-like protein  30 
 
 
1152 aa  54.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  normal  0.309212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4181  filamentous haemagglutinin-like protein  32.31 
 
 
759 aa  52.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.3 
 
 
1772 aa  51.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2353  filamentous haemagglutinin-like protein  36.84 
 
 
824 aa  50.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2349  filamentous haemagglutinin-like protein  32.73 
 
 
804 aa  50.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2530  filamentous haemagglutinin-like protein  30.19 
 
 
776 aa  50.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.957928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0834  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.73 
 
 
795 aa  49.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0180424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2945  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.32 
 
 
585 aa  48.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.214407  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.13 
 
 
2782 aa  48.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0285  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  24.77 
 
 
1195 aa  48.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579969  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0285  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  24.77 
 
 
1202 aa  48.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0837  hemagglutination domain-containing protein  30 
 
 
139 aa  47.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0185805  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  25.99 
 
 
3301 aa  47.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2359  hypothetical protein  40.3 
 
 
212 aa  47.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.486627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  26.18 
 
 
3350 aa  47.8  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3442  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.31 
 
 
952 aa  47.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0006  filamentous haemagglutinin-like protein  32.63 
 
 
845 aa  47  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  37.31 
 
 
122 aa  47  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.66 
 
 
4219 aa  47  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0651  hypothetical protein  31.67 
 
 
3954 aa  47  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1755  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  46.77 
 
 
965 aa  46.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>