93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2172 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
2834 aa  5423    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.13 
 
 
3589 aa  315  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  37.88 
 
 
1451 aa  306  4.0000000000000003e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  38.57 
 
 
1447 aa  291  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.41 
 
 
1105 aa  280  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.13 
 
 
4016 aa  278  9e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.05 
 
 
2054 aa  270  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  36.09 
 
 
1910 aa  269  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  39.8 
 
 
1371 aa  261  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.53 
 
 
2744 aa  223  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.49 
 
 
2887 aa  218  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  34.84 
 
 
1999 aa  209  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.43 
 
 
1137 aa  197  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.45 
 
 
800 aa  194  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  40.45 
 
 
1003 aa  194  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  40.62 
 
 
2716 aa  192  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.22 
 
 
985 aa  185  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.61 
 
 
4500 aa  183  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  41.26 
 
 
770 aa  183  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  38.49 
 
 
1018 aa  182  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.88 
 
 
956 aa  182  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.26 
 
 
1004 aa  180  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  35.22 
 
 
2271 aa  179  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  34.48 
 
 
1994 aa  177  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  35.79 
 
 
1009 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.42 
 
 
1148 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  36.68 
 
 
991 aa  176  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  39.44 
 
 
1417 aa  175  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.77 
 
 
1691 aa  175  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  37.65 
 
 
1419 aa  172  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.15 
 
 
2387 aa  172  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  34.29 
 
 
2328 aa  172  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.3 
 
 
5613 aa  169  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.22 
 
 
2217 aa  166  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.23 
 
 
3132 aa  161  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  33.13 
 
 
2334 aa  161  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.5 
 
 
607 aa  160  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  36.39 
 
 
2079 aa  160  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  34.5 
 
 
1058 aa  158  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.68 
 
 
1637 aa  155  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.41 
 
 
4855 aa  154  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  33.85 
 
 
390 aa  149  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  32.56 
 
 
1169 aa  142  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.55 
 
 
481 aa  131  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.6 
 
 
2637 aa  129  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.63 
 
 
1844 aa  116  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  28.12 
 
 
2679 aa  110  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  30.8 
 
 
3349 aa  103  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.75 
 
 
3340 aa  94.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  28.24 
 
 
3299 aa  94.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  31.49 
 
 
1013 aa  94  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  29.88 
 
 
1741 aa  89  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.32 
 
 
759 aa  82  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.42 
 
 
1650 aa  80.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.25 
 
 
3298 aa  79  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.59 
 
 
3537 aa  79  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  32.56 
 
 
4007 aa  77.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  31.54 
 
 
4009 aa  77.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.05 
 
 
3299 aa  75.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  30.29 
 
 
4135 aa  75.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  32.18 
 
 
4049 aa  74.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  30.59 
 
 
4347 aa  72.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  27.2 
 
 
3332 aa  72  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  28.23 
 
 
715 aa  72.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  32.39 
 
 
4030 aa  71.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.09 
 
 
3419 aa  70.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.09 
 
 
3535 aa  70.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  33.33 
 
 
4177 aa  67.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  31.5 
 
 
3472 aa  66.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  29.68 
 
 
4435 aa  61.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  32.12 
 
 
4184 aa  62  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  29.35 
 
 
4170 aa  59.3  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.68 
 
 
946 aa  58.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  28.29 
 
 
3409 aa  58.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2353  filamentous haemagglutinin-like protein  33.6 
 
 
824 aa  54.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  28.99 
 
 
4132 aa  53.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1743  putative periplasmic protein  32.5 
 
 
553 aa  53.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0529  putative periplasmic protein  32.5 
 
 
553 aa  53.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.935894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3442  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.81 
 
 
952 aa  51.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.62 
 
 
1570 aa  50.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3737  filamentous haemagglutinin-like protein  37.04 
 
 
805 aa  51.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2674  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  29.81 
 
 
952 aa  50.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.86 
 
 
1772 aa  48.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.41 
 
 
808 aa  48.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2352  filamentous haemagglutinin-like protein  53.06 
 
 
820 aa  48.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0006  filamentous haemagglutinin-like protein  28.15 
 
 
845 aa  47.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4181  filamentous haemagglutinin-like protein  34.62 
 
 
759 aa  47.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2810  filamentous haemagglutinin-like protein  38.27 
 
 
1152 aa  46.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  normal  0.309212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.81 
 
 
1349 aa  47  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  33.08 
 
 
1672 aa  46.2  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2350  filamentous haemagglutinin-like protein  54.76 
 
 
816 aa  46.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.883366  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2811  filamentous haemagglutinin-like protein  38.75 
 
 
1140 aa  46.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0282223  normal  0.417754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.1 
 
 
1391 aa  46.2  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>