70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2234 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  37.96 
 
 
4177 aa  892    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  37.79 
 
 
4184 aa  872    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  39.31 
 
 
4170 aa  950    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  37.48 
 
 
4135 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  35.34 
 
 
4132 aa  808    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  45.21 
 
 
4347 aa  1948    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  100 
 
 
4009 aa  7799    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  40.52 
 
 
4030 aa  2260    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  40.42 
 
 
4049 aa  2214    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  49.9 
 
 
4007 aa  768    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.65 
 
 
4219 aa  363  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  27.56 
 
 
3472 aa  296  7e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  27.14 
 
 
3409 aa  293  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  28.22 
 
 
4283 aa  266  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  27.06 
 
 
3332 aa  262  9e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  27.62 
 
 
3349 aa  258  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  27.37 
 
 
4435 aa  206  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  27.19 
 
 
3299 aa  192  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.02 
 
 
3340 aa  162  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  35.74 
 
 
2334 aa  114  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  35.68 
 
 
2328 aa  109  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.17 
 
 
2887 aa  105  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.71 
 
 
800 aa  102  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  34.26 
 
 
770 aa  103  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.99 
 
 
1105 aa  100  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.71 
 
 
956 aa  99.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.82 
 
 
4500 aa  98.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  32.41 
 
 
1447 aa  97.1  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.59 
 
 
2217 aa  97.1  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  36.68 
 
 
1058 aa  95.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  30.09 
 
 
1009 aa  95.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.18 
 
 
3589 aa  95.5  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  29.86 
 
 
1999 aa  94.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.59 
 
 
1137 aa  95.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.74 
 
 
4016 aa  92.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  33.33 
 
 
1003 aa  92.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.37 
 
 
5613 aa  93.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  32.79 
 
 
1371 aa  92  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.93 
 
 
985 aa  90.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.7 
 
 
4855 aa  90.1  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  35.48 
 
 
1451 aa  89.4  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  32.18 
 
 
2079 aa  88.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.94 
 
 
607 aa  87.4  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  32.12 
 
 
1419 aa  86.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.5 
 
 
2387 aa  86.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.36 
 
 
1081 aa  85.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  31.72 
 
 
1018 aa  85.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  33.33 
 
 
1417 aa  83.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.95 
 
 
1844 aa  82.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.36 
 
 
1148 aa  82.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  35.8 
 
 
991 aa  81.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  31.98 
 
 
2716 aa  80.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.58 
 
 
3132 aa  80.9  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.98 
 
 
2054 aa  80.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  37.6 
 
 
2679 aa  80.1  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  28.7 
 
 
1169 aa  79.7  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  32.92 
 
 
390 aa  78.6  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  32.33 
 
 
1910 aa  78.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  31.64 
 
 
2271 aa  78.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  31.64 
 
 
1994 aa  78.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.54 
 
 
2834 aa  77.4  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.59 
 
 
808 aa  72.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30 
 
 
481 aa  72  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.16 
 
 
2744 aa  67.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  27.93 
 
 
1691 aa  66.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  30.56 
 
 
1741 aa  65.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.57 
 
 
1637 aa  64.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4093  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.39 
 
 
946 aa  64.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.13 
 
 
759 aa  63.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  30.99 
 
 
715 aa  63.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>