103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4014 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
956 aa  1855    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.19 
 
 
1105 aa  299  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  37.66 
 
 
1451 aa  228  6e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  38.58 
 
 
1371 aa  223  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  39.53 
 
 
1447 aa  220  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.93 
 
 
3589 aa  215  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.78 
 
 
2744 aa  206  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.43 
 
 
4016 aa  200  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  38.57 
 
 
1691 aa  190  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  32.68 
 
 
1910 aa  183  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.03 
 
 
2887 aa  177  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.81 
 
 
2054 aa  177  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.06 
 
 
5613 aa  176  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  37.23 
 
 
1994 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  37.23 
 
 
2271 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.2 
 
 
2387 aa  159  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.92 
 
 
3132 aa  155  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.53 
 
 
3340 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.16 
 
 
607 aa  153  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.88 
 
 
2834 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1512  filamentous haemagglutinin-like protein  33.8 
 
 
1999 aa  150  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  38.78 
 
 
2334 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  38.89 
 
 
2328 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.43 
 
 
1081 aa  146  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.58 
 
 
2217 aa  145  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.61 
 
 
985 aa  145  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  37.9 
 
 
770 aa  144  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.79 
 
 
3419 aa  143  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  38.57 
 
 
1058 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.27 
 
 
3299 aa  140  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.89 
 
 
1148 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  38.08 
 
 
991 aa  140  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.81 
 
 
1137 aa  139  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  36.97 
 
 
1003 aa  138  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.6 
 
 
3535 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.54 
 
 
481 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.13 
 
 
800 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.3 
 
 
4855 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  36.6 
 
 
1419 aa  135  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  30.22 
 
 
2679 aa  135  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  38.75 
 
 
2716 aa  134  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  39.92 
 
 
2079 aa  131  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  35.38 
 
 
3299 aa  128  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.45 
 
 
2637 aa  128  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.23 
 
 
1637 aa  124  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  35.85 
 
 
1009 aa  124  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.94 
 
 
1650 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  31.12 
 
 
1169 aa  120  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.72 
 
 
1004 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.91 
 
 
3537 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  31.82 
 
 
390 aa  119  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.19 
 
 
4500 aa  118  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.15 
 
 
3298 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  35.48 
 
 
1018 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  35.95 
 
 
1417 aa  115  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  35.88 
 
 
3349 aa  112  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2234  filamentous haemagglutinin-like protein  35.71 
 
 
4009 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2207  filamentous haemagglutinin-like protein  33.19 
 
 
4049 aa  96.3  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.370432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.78 
 
 
1772 aa  95.1  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2214  filamentous haemagglutinin-like protein  33.94 
 
 
4030 aa  91.3  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.699209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.01 
 
 
1844 aa  90.9  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0482  haemagglutinin-like protein  33.46 
 
 
4007 aa  90.1  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2405  filamentous haemagglutinin-like protein  31.78 
 
 
3332 aa  89.7  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.621417 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5862  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.63 
 
 
808 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55400  hypothetical protein  33.79 
 
 
4177 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3126  filamentous haemagglutinin-like protein  30.08 
 
 
4347 aa  87.8  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.588086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1127  filamentous haemagglutinin  35.56 
 
 
715 aa  87.8  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2206  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  30.95 
 
 
4132 aa  87.4  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.498823 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5861  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.09 
 
 
759 aa  85.1  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.29882  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0355  filamentous haemagglutinin-like protein  30.03 
 
 
3472 aa  84.7  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.06862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2911  filamentous haemagglutinin-like protein  31.89 
 
 
4135 aa  84.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4821  hemagglutination repeat-containing protein  31.71 
 
 
4184 aa  81.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2575  filamentous hemeagglutinin-like protein  28.12 
 
 
3409 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.62 
 
 
1741 aa  79.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2110  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.38 
 
 
4219 aa  73.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.328655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2997  filamentous haemagglutinin-like protein  30.56 
 
 
4435 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3171  filamentous haemagglutinin-like protein  28.83 
 
 
4170 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.336923 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  28.37 
 
 
1013 aa  65.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0651  hypothetical protein  25.57 
 
 
3954 aa  64.3  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1068  haemagglutinin-like  43.68 
 
 
4283 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4131  filamentous haemagglutinin-like protein  36.49 
 
 
848 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343736  normal  0.0350194 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0529  putative periplasmic protein  34.94 
 
 
553 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.935894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1743  putative periplasmic protein  34.94 
 
 
553 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.11339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1755  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.21 
 
 
965 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2353  filamentous haemagglutinin-like protein  24.28 
 
 
824 aa  52  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0285  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.18 
 
 
1202 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3442  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.54 
 
 
952 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0285  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  26.18 
 
 
1195 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579969  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2674  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  32.54 
 
 
952 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5479  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  37.31 
 
 
816 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468163 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0006  filamentous haemagglutinin-like protein  31.46 
 
 
845 aa  48.9  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3737  filamentous haemagglutinin-like protein  25 
 
 
805 aa  48.9  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1009  hypothetical protein  35.71 
 
 
122 aa  48.5  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.94 
 
 
1570 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1530  conserved hypothetical protein, hemagglutination domain protein  34.33 
 
 
1085 aa  48.5  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.307259  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.5 
 
 
1349 aa  48.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0379  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.33 
 
 
1073 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0161593  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.5 
 
 
1391 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2972  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.96 
 
 
823 aa  46.6  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2349  filamentous haemagglutinin-like protein  33.72 
 
 
804 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>