228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3705 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  100 
 
 
1105 aa  2005    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1781  heme-hemopexin-binding/utilization protein  72.81 
 
 
770 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  45.9 
 
 
1451 aa  376  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  45.36 
 
 
1447 aa  369  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  41.49 
 
 
2716 aa  351  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03099  putative hemagglutinin-related protein  48.36 
 
 
1371 aa  341  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.726072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.11 
 
 
4016 aa  340  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.64 
 
 
800 aa  329  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2695  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.98 
 
 
3589 aa  323  9.000000000000001e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.23 
 
 
2054 aa  323  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  40.98 
 
 
1910 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4014  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.82 
 
 
956 aa  314  6.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.893958  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.82 
 
 
985 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  44.58 
 
 
1137 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.02 
 
 
4500 aa  275  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  49.22 
 
 
1417 aa  274  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.38 
 
 
1004 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  49.26 
 
 
1058 aa  272  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.06 
 
 
5613 aa  270  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  48.48 
 
 
2079 aa  268  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  49.54 
 
 
1419 aa  268  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  50 
 
 
2334 aa  265  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  49.35 
 
 
2328 aa  264  6.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0940  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  41.05 
 
 
1691 aa  260  8e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.39 
 
 
1148 aa  260  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  49.09 
 
 
991 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3059  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  50.68 
 
 
2387 aa  254  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.820187  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2172  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39.33 
 
 
2834 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.718813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0481  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  39 
 
 
2744 aa  250  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  45.27 
 
 
1009 aa  250  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  49.16 
 
 
1081 aa  249  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  48.15 
 
 
607 aa  248  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.54 
 
 
3132 aa  243  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11100  adhesive protein CupB5  45.17 
 
 
1018 aa  241  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280418  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2461  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.96 
 
 
1637 aa  226  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489367  normal  0.518001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0010  filamentous haemagglutinin-like protein  43.66 
 
 
1169 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  38.4 
 
 
2271 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  39.29 
 
 
1994 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  70.34 
 
 
459 aa  221  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  43.59 
 
 
390 aa  220  8.999999999999998e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  69.42 
 
 
462 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  53.2 
 
 
813 aa  213  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  66.15 
 
 
1219 aa  213  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  60.18 
 
 
936 aa  210  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  64.94 
 
 
1055 aa  207  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  57.06 
 
 
1147 aa  206  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  53.66 
 
 
842 aa  206  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2096  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.53 
 
 
2887 aa  204  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  57.44 
 
 
706 aa  204  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  61.61 
 
 
1168 aa  201  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1149  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.48 
 
 
2217 aa  200  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  56.07 
 
 
748 aa  200  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  54.46 
 
 
712 aa  199  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  58.64 
 
 
1451 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  61.14 
 
 
1580 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  57.84 
 
 
815 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  57.1 
 
 
512 aa  196  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5785  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  43.69 
 
 
4855 aa  191  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  54.78 
 
 
643 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3524  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  40.46 
 
 
481 aa  186  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.838951  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  56.5 
 
 
639 aa  170  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  61.64 
 
 
606 aa  165  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.77 
 
 
2637 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  42.99 
 
 
2914 aa  157  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  54.01 
 
 
585 aa  152  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  58.51 
 
 
524 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1008  GLUG  36.92 
 
 
1013 aa  144  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0504  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.81 
 
 
1844 aa  142  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  45.24 
 
 
835 aa  138  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  60.96 
 
 
300 aa  138  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  48.01 
 
 
835 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  46.5 
 
 
838 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  43.27 
 
 
1321 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  46.78 
 
 
835 aa  132  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  48.12 
 
 
1170 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  45.07 
 
 
867 aa  129  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  61.26 
 
 
426 aa  128  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  43.71 
 
 
934 aa  127  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  31.97 
 
 
2679 aa  126  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.96 
 
 
3419 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.52 
 
 
3535 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2227  hemagglutinin-related protein  34.07 
 
 
3349 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  72.95 
 
 
380 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.52 
 
 
3299 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2610  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.03 
 
 
3340 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  33.8 
 
 
1873 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  47.62 
 
 
1297 aa  115  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  70.16 
 
 
326 aa  115  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  62.77 
 
 
252 aa  112  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  64.52 
 
 
348 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  40.28 
 
 
542 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  60.74 
 
 
469 aa  112  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  37.91 
 
 
951 aa  111  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1458  filamentous haemagglutinin-like protein  33.59 
 
 
3299 aa  111  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  31.75 
 
 
1741 aa  110  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  39.37 
 
 
322 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  50.75 
 
 
481 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  50.75 
 
 
478 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.3 
 
 
3537 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.18 
 
 
1650 aa  106  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>