139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0713 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 322 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  86.34 
 
 		 319 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  45.78 
 
 		 842 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  50.65 
 
 		 936 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  42.67 
 
 		 748 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  49.15 
 
 		 1147 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  44.54 
 
 		 1219 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  51.83 
 
 		 1168 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  46.77 
 
 		 813 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  43.24 
 
 		 512 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  41.28 
 
 		 459 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  42.32 
 
 		 1055 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  44.3 
 
 		 815 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  42.2 
 
 		 462 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  43.88 
 
 		 712 aa  135  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  47.3 
 
 		 835 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  48.46 
 
 		 1451 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  46.86 
 
 		 835 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  48.73 
 
 		 706 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  44.79 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  44.74 
 
 		 1580 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  49.22 
 
 		 643 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  49.77 
 
 		 585 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  50.58 
 
 		 2914 aa  129  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  47.66 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  44.7 
 
 		 1321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  46.61 
 
 		 1170 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  48.17 
 
 		 951 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  45.02 
 
 		 838 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  46.96 
 
 		 1297 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  46.15 
 
 		 835 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  51.69 
 
 		 382 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  37.76 
 
 		 524 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  41.07 
 
 		 934 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  44.53 
 
 		 606 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  47.8 
 
 		 867 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  43.12 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  48.91 
 
 		 444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  44.98 
 
 		 835 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  41.49 
 
 		 400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  42.75 
 
 		 542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  49.15 
 
 		 582 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  45.45 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  40.89 
 
 		 481 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  40.16 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  47.5 
 
 		 587 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  39.35 
 
 		 645 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  45.12 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  46.75 
 
 		 493 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  36.74 
 
 		 1873 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  46.41 
 
 		 473 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  38.17 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  48.04 
 
 		 2851 aa  99.4  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  43.13 
 
 		 468 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.77 
 
 		 689 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  40.66 
 
 		 639 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  34.44 
 
 		 426 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  59.06 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  40 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  45.78 
 
 		 252 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  43.75 
 
 		 582 aa  92.8  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  47.8 
 
 		 474 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  44.59 
 
 		 348 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  50 
 
 		 437 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  46.09 
 
 		 1101 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  50 
 
 		 439 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  36.92 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  42.01 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  31.52 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  46.85 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  50.77 
 
 		 767 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  39.11 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  46.96 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  46.96 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  44.53 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  49.74 
 
 		 648 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  48.15 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  46.09 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  48.15 
 
 		 438 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  48.15 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  48.15 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  53.1 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  44.52 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  46.43 
 
 		 839 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  47.22 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  49.04 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  46.32 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  42.19 
 
 		 1426 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  38.49 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  50.44 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  43.62 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  54.12 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  46.73 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  43.85 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  54.12 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_009038  Sbal_4480  hypothetical protein  32.04 
 
 		 615 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2195  triple helix repeat-containing collagen  32.04 
 
 		 615 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  30.1 
 
 		 717 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  43.2 
 
 		 580 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  29.41 
 
 		 688 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>