152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1925 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 492 aa  984    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  88.84 
 
 		 493 aa  837    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  38.97 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  37.93 
 
 		 582 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  32.83 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  33.33 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  49.77 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  49.51 
 
 		 748 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  49.77 
 
 		 712 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  49.28 
 
 		 842 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  42.96 
 
 		 2914 aa  137  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  45.54 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  47.35 
 
 		 512 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  49.07 
 
 		 1168 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  50.24 
 
 		 1147 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  48.53 
 
 		 813 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  48.08 
 
 		 706 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  44.49 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  47.49 
 
 		 643 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  48.54 
 
 		 835 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  47.6 
 
 		 1451 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  47.03 
 
 		 936 aa  127  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  44.81 
 
 		 815 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  44.96 
 
 		 835 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  44.62 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  52.87 
 
 		 582 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  39.38 
 
 		 442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  51.18 
 
 		 1297 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  50 
 
 		 1170 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  43.05 
 
 		 1219 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  49.74 
 
 		 951 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  46.41 
 
 		 838 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  42.29 
 
 		 1055 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  45.71 
 
 		 835 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  44.89 
 
 		 1321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  41.81 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  48.91 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  42.26 
 
 		 867 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  40.81 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  40.91 
 
 		 382 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  44.44 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  41.04 
 
 		 2851 aa  106  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  44.5 
 
 		 606 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.14 
 
 		 689 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  40.16 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  44.04 
 
 		 1580 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  34.71 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  41.03 
 
 		 473 aa  103  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  43.95 
 
 		 934 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  46.25 
 
 		 348 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  38.21 
 
 		 639 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  38.82 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  47.22 
 
 		 481 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  42.13 
 
 		 835 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  43.46 
 
 		 542 aa  99  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  47.28 
 
 		 474 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1408 aa  97.4  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  49.38 
 
 		 307 aa  94  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  43.27 
 
 		 645 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  34.53 
 
 		 344 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  41.52 
 
 		 439 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  41.52 
 
 		 437 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  46.07 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  44.03 
 
 		 523 aa  87  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  45.93 
 
 		 252 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  44.38 
 
 		 1101 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  50.45 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  50.45 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  43.1 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  41.9 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  48.67 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  47.5 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  36.44 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  40.68 
 
 		 647 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  32.13 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  38.1 
 
 		 1873 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  49.46 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  43.24 
 
 		 580 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  49.06 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  50.94 
 
 		 1426 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  49.06 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  33.04 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  38.74 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  49.06 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  53.49 
 
 		 299 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  49.15 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  52.53 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  49.37 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  48.86 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  47.32 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  35.15 
 
 		 767 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  44.96 
 
 		 300 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  42.06 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  46 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  48.67 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  37.23 
 
 		 839 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  46.79 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  38.46 
 
 		 648 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2472  triple helix repeat-containing collagen  45.19 
 
 		 183 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  50.54 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>