| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | BT9727_3456 |
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| Symbol | |
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| ID | 2855303 |
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| Type | CDS |
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| Is gene spliced | No |
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| Is pseudo gene | No |
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| Organism name | Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 |
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| Kingdom | Bacteria |
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| Replicon accession | NC_005957 |
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| Strand | + |
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| Start bp | 3540158 |
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| End bp | 3543664 |
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| Gene Length | 3507 bp |
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| Protein Length | 1168 aa |
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| Translation table | 11 |
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| GC content | 54% |
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| IMG OID | 637514875 |
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| Product | triple helix repeat-containing collagen |
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| Protein accession | YP_037777 |
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| Protein GI | 49478336 |
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| COG category | [S] Function unknown |
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| COG ID | [COG4886] Leucine-rich repeat (LRR) protein |
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| TIGRFAM ID | |
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Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 8 |
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| Plasmid unclonability p-value | 0.00439724 |
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| Plasmid hitchhiking | No |
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| Plasmid clonability | decreased coverage |
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Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
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| Fosmid unclonability p-value | n/a |
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| Fosmid Hitchhiker | n/a |
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| Fosmid clonability | n/a |
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Sequence |
| Gene sequence | ATGTCTCGTT ATGACGACAG TCAAAACAAA TTCTCCAAAC CATGCTTTCC AAGTAGCGCT
GGACGAATCC CGAATACTCC ATCAATCCCA GTTACTAAGG CACAACTTAG AACATTTCGC
GCAATCATTA TTGATTTAAC AAAAATAATC CCAAAACTTT TCGCAAATCC ATCTCCCCAA
AATATTGAAG ATCTAATCGA TACATTGAAC CTACTAAGTA AATTTATTTG TTCACTAGAC
GCTGCTTCCT CCCTGAAAGC ACAAGGATTA GCTATTATTA AAAACTTAAT AACTATATTA
AAAAACCCAA CTTTCGTAGC AAGTGCTGTA TTTATCGAGC TTCAAAATCT AATTAATTAT
TTACTATCCA TTACAAAACT ATTCCGAATT GACCCTTGCA CACTTCAAGA GCTTCTTAAA
TTAATAGCAG CATTACAAAC CGCTTTAGTT AATTCTGCTT CATTCATTCA AGGACCTACT
GGACCTACTG GGCCAGCTGG TGCTACTGGT GCCACTGGAC CTCAGGGTGC TCAAGGTAAC
ACCGGTGCTA CTGGTGCCAC TGGACCTCAA GGCGCTCAAG GTAACACGGG CGCTACTGGA
CCTCAGGGTG TTCAAGGTAA CACGGGCGCT ACTGGTGCCA CTGGACCTCA AGGCGCTCAA
GGTAACACAG GTGCTACTGG TGCCACTGGA CCTCAGGGTG CTCAAGGTAA CACAGGCGCT
ACTGGACCTC AAGGCGCTCA AGGACCAGCG GGTGCTACTG GCGCTACTGG ACCTCAAGGC
GCTCAAGGTA ACACCGGTGC TACTGGTGCC ACTGGACCTC AAGGCGCTCA AGGACCAGCG
GGTGCTACTG GCGCTACTGG ACCTCAGGGT GTTCAAGGTA ACACAGGTGC TACTGGACCT
CAGGGTATTC AAGGTAACAC GGGCGCTACT GGTGCTACCG GCATAGGAGT TACCGGACCT
ACTGGGCCTT CTGGTGGGCC TCCTGGACCT ACTGGACCTC AAGGTAACAC GGGTGCTACT
GGTGCCACTG GACCTCAAGG CGCTCAAGGA CCAGCGGGTG CTACTGGCGC TACTGGACCT
CAAGGCGTTC AAGGTAACAC AGGTGCTACC GGTGCCACTG GACCTCAAGG CGCTCAAGGA
CCAGCGGGTG CTACTGGCGC TACTGGACCT CAAGGCGTTC AAGGTAACAC AGGTGCTACC
GGTGCCACTG GACCTCAAGG CGCTCAAGGA CCAGCAGGTG CTACTGGCGC TACTGGACCT
CAAGGCGTTC AAGGTAACAC AGGTGCTACT GGCGCCACTG GACCTCAAGG CGTTCAAGGT
AACACAGGTG CTACTGGCGC TACTGGACCT CAGGGTGTTC AAGGTAACAC AGGTGCTACT
GGCGCTACTG GACCTCAAGG CGTTCAAGGT AACACAGGTG CTACTGGCGC TACTGGACCT
CAGGGTGTTC AAGGACCAGC GGGTGCTACC GGTGCCACTG GACCTCAAGG TGTTCAAGGA
CCAGCAGGTG CTACTGGCGC TACTGGACCT CAAGGTAACA CGGGTGCTAC TGGTGCCACT
GGACCTCAAG GCGCTCAAGG ACCAGCGGGT GCTACTGGCG CTACTGGACC TCAAGGCGTT
CAAGGTAACA CAGGTGCTAC CGGTGCCACT GGACCTCAAG GCGCTCAAGG ACCAGCAGGT
GCTACTGGTG CCACTGGACC TCAAGGTGTT CAAGGTAACA CAGGTGCTAC CGGTGCCACT
GGACCTCAAG GTGTTCAAGG TAACACAGGT GCTACCGGTG CCACTGGACC TCAAGGTGTT
CAAGGGCCAG CAGGTGCTAC CGGTGCCACT GGACCTCAAG GTGTTCAAGG TAACACGGGT
GCTACTGGTG CCACTGGACC TCAAGGTAAC ACGGGCGCTA CTGGACCTCA GGGTGTTCAA
GGACCAGCGG GTGCTACCGG TGCCACTGGA CCTCAAGGTG TTCAAGGACC AGCAGGTGCT
ACCGGTGCTA CTGGACCTCA GGGTGTTCAA GGACCAGCGG GTGCTACTGG TGCCACTGGA
CCTCAAGGTG TTCAAGGTAA CACGGGTGCT ACTGGTGCCA CTGGACCTCA AGGTAACACG
GGCGCTACTG GACCTCAAGG TGTTCAAGGA CCAGCAGGTG CTACCGGTGC TACTGGACCT
CAAGGCGCTC AAGGACCAGC AGGTGCTACC GGTGCTACTG GACCTCAAGG TGTTCAAGGT
AACACGGGTG CTACTGGTGC CACTGGACCT CAAGGTGTTC AAGGACCAGC AGGTGCTACT
GGTGCCACTG GACCTCAAGG TATTCAAGGA CCAGCAGGTG CTACTGGCGC TACTGGACCT
CAAGGTGCTC AAGGACCAGC AGGTGCTACT GGTGCCACTG GACCTCAAGG TGTTCAAGGA
CCAGCAGGTG CTACCGGTGC TACTGGACCT CAAGGTGTTC AAGGGCCAGC AGGTGCTACC
GGTGCTACTG GACCTCAAGG TGCTCAAGGA CCAGCAGGTG CTACGGGCGC TACTGGACCT
CAAGGTGTTC AAGGACCAGC GGGTGCTACT GGCGCTACTG GACCTCAAGG TGTTCAAGGT
AACACGGGTG CTACTGGTGC CACTGGACCT CAAGGTGCTC AAGGTAACAC GGGCGCTACT
GGACCTCAAG GTGCTCAAGG ACCAGCAGGT GCTACCGGTG CCACTGGACC TCAAGGCGTT
CAAGGTAACA CAGGTGCTAC TGGTGCCACT GGACCTCAAG GCGCTCAAGG ACCAGCAGGT
GCTACCGGTG CTACTGGACC TCAAGGTGTT CAAGGACCAG CAGGTGCTAC GGGCGCTACT
GGACCTCAAG GCGTTCAAGG GCCAACGGGC GCTACTGGTA TAGGAGTTAC CGGACCTACT
GGGCCTTCTG GTGGACCTCC TGGACCTACT GGACCTCAGG GACCTCAAGG TAATACAGGT
GCTACTGGAC CTCAAGGTAT TCAAGGGCCT GCTGGTGCTA CTGGTGCCAC TGGACCTCAA
GGTGCTCAAG GACCGGCTGG TGCTACCGGC GCTACTGGAC CTCAAGGTGT TCAAGGGCCA
ACGGGTGCTA CTGGTATAGG AGTTACCGGA CCTACTGGGC CTTCTGGACC TAGCTTCCCT
GTAGCAACAA TTGTTGTAAC AAACAACATT CAACAAACAG TACTCCAATT TAACAACTTC
ATTTTTAATA CTGCAATTAA CGTAAACAAC ATTATCTTCA ACGGCACAGA TACAGTTACT
GTTATCAACG CTGGTATTTA TGTCATTAGC GTATCCATCT CTACAACTGC ACCAGGATGT
GCACCACTCG GAGTAGGAAT TTCAATAAAT GGAGCAGTCG CAACTGACAA CTTCTCTTCA
AATCTAATAG GCGACTCACT TTCATTCACT ACGATCGAAA CGTTAACTGC CGGCGCGAAC
ATTTCTGTCC AATCCACTCT TAATGAGATT ACGATCCCTG CAACAGGAAA CACTAATATT
CGTCTAACTG TATTTAGAAT CGCTTAA
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| Protein sequence | MSRYDDSQNK FSKPCFPSSA GRIPNTPSIP VTKAQLRTFR AIIIDLTKII PKLFANPSPQ
NIEDLIDTLN LLSKFICSLD AASSLKAQGL AIIKNLITIL KNPTFVASAV FIELQNLINY
LLSITKLFRI DPCTLQELLK LIAALQTALV NSASFIQGPT GPTGPAGATG ATGPQGAQGN
TGATGATGPQ GAQGNTGATG PQGVQGNTGA TGATGPQGAQ GNTGATGATG PQGAQGNTGA
TGPQGAQGPA GATGATGPQG AQGNTGATGA TGPQGAQGPA GATGATGPQG VQGNTGATGP
QGIQGNTGAT GATGIGVTGP TGPSGGPPGP TGPQGNTGAT GATGPQGAQG PAGATGATGP
QGVQGNTGAT GATGPQGAQG PAGATGATGP QGVQGNTGAT GATGPQGAQG PAGATGATGP
QGVQGNTGAT GATGPQGVQG NTGATGATGP QGVQGNTGAT GATGPQGVQG NTGATGATGP
QGVQGPAGAT GATGPQGVQG PAGATGATGP QGNTGATGAT GPQGAQGPAG ATGATGPQGV
QGNTGATGAT GPQGAQGPAG ATGATGPQGV QGNTGATGAT GPQGVQGNTG ATGATGPQGV
QGPAGATGAT GPQGVQGNTG ATGATGPQGN TGATGPQGVQ GPAGATGATG PQGVQGPAGA
TGATGPQGVQ GPAGATGATG PQGVQGNTGA TGATGPQGNT GATGPQGVQG PAGATGATGP
QGAQGPAGAT GATGPQGVQG NTGATGATGP QGVQGPAGAT GATGPQGIQG PAGATGATGP
QGAQGPAGAT GATGPQGVQG PAGATGATGP QGVQGPAGAT GATGPQGAQG PAGATGATGP
QGVQGPAGAT GATGPQGVQG NTGATGATGP QGAQGNTGAT GPQGAQGPAG ATGATGPQGV
QGNTGATGAT GPQGAQGPAG ATGATGPQGV QGPAGATGAT GPQGVQGPTG ATGIGVTGPT
GPSGGPPGPT GPQGPQGNTG ATGPQGIQGP AGATGATGPQ GAQGPAGATG ATGPQGVQGP
TGATGIGVTG PTGPSGPSFP VATIVVTNNI QQTVLQFNNF IFNTAINVNN IIFNGTDTVT
VINAGIYVIS VSISTTAPGC APLGVGISIN GAVATDNFSS NLIGDSLSFT TIETLTAGAN
ISVQSTLNEI TIPATGNTNI RLTVFRIA
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