128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5054 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  38.77 
 
 		 1219 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  39.74 
 
 		 1055 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  46.72 
 
 		 748 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  48.37 
 
 		 838 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  38.79 
 
 		 815 aa  132  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  44.44 
 
 		 936 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  45.76 
 
 		 835 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  47.39 
 
 		 512 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  51.57 
 
 		 835 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  40.64 
 
 		 459 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  45.8 
 
 		 706 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  53.42 
 
 		 842 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  40.91 
 
 		 462 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  46.69 
 
 		 1170 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  48.18 
 
 		 1168 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  47.06 
 
 		 1451 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  47.49 
 
 		 1147 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  47.39 
 
 		 835 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  45.53 
 
 		 835 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  48.23 
 
 		 867 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  42.08 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  34.69 
 
 		 524 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  50.71 
 
 		 585 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  47.95 
 
 		 813 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  47.51 
 
 		 712 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  47.49 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  45.74 
 
 		 951 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  43.79 
 
 		 1297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  48.1 
 
 		 1321 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  42.09 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 934 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  49.32 
 
 		 473 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  46.38 
 
 		 442 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  45.49 
 
 		 643 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 403 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  38.84 
 
 		 1580 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  49.72 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  46.35 
 
 		 582 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  39.29 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  29.76 
 
 		 469 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  39.32 
 
 		 606 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  44.9 
 
 		 587 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  41.43 
 
 		 468 aa  89.7  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  41.28 
 
 		 466 aa  89.4  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  34.54 
 
 		 639 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  33.94 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  43.75 
 
 		 542 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  43.28 
 
 		 492 aa  86.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  48.3 
 
 		 689 aa  86.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  38.29 
 
 		 647 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  35.74 
 
 		 1873 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  47.83 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  46.91 
 
 		 2914 aa  84  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  35.41 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  44.39 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  35.02 
 
 		 645 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  40.82 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  41.83 
 
 		 481 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  41.83 
 
 		 478 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  44.44 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  40.4 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  41.71 
 
 		 582 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  38.22 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  45.71 
 
 		 717 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  40.5 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  48.19 
 
 		 767 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  39.62 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  40.59 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  30.95 
 
 		 688 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  39.16 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  39.16 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  25.29 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  43.81 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  44.8 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  39.26 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  40 
 
 		 648 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  38.71 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  44.55 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  44.55 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  43.43 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  59.7 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1354  sulfatase  39.42 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  43.4 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  45.35 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  47.13 
 
 		 445 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  35.35 
 
 		 1101 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  53.95 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  42.59 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1432  pseudouridine synthase, Rsu  34.39 
 
 		 610 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  38.1 
 
 		 839 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  42.86 
 
 		 2851 aa  56.6  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  49.47 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  49.47 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  49.47 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  50 
 
 		 434 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  43.82 
 
 		 580 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  40.88 
 
 		 474 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>