144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5064 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  61.78 
 
 		 648 aa  663    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 839 aa  1538    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  70.72 
 
 		 767 aa  997    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4075  hypothetical protein  94.81 
 
 		 137 aa  257  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110261  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  29.72 
 
 		 1408 aa  156  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  29.3 
 
 		 1219 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  30.38 
 
 		 1055 aa  135  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  51.67 
 
 		 442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  42.92 
 
 		 815 aa  126  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  51.76 
 
 		 2914 aa  124  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0244  hypothetical protein  46.25 
 
 		 267 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  43.64 
 
 		 813 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  53.41 
 
 		 382 aa  120  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  48.89 
 
 		 582 aa  119  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  44.71 
 
 		 319 aa  118  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  34.15 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  37.45 
 
 		 712 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  52.91 
 
 		 403 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  44.86 
 
 		 606 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  43.94 
 
 		 2851 aa  114  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  40.19 
 
 		 936 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  44.88 
 
 		 585 aa  111  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  41.1 
 
 		 492 aa  111  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  34.32 
 
 		 462 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  50.7 
 
 		 322 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  45.62 
 
 		 643 aa  108  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  35.16 
 
 		 706 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  43.98 
 
 		 1168 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  37.3 
 
 		 748 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  42.8 
 
 		 512 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  44.97 
 
 		 468 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  39.17 
 
 		 587 aa  106  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  46.6 
 
 		 300 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  39.71 
 
 		 466 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  42.92 
 
 		 838 aa  102  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  42.5 
 
 		 473 aa  101  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  49.73 
 
 		 344 aa  100  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  47.83 
 
 		 400 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  45.93 
 
 		 842 aa  100  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  33.76 
 
 		 524 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  37.66 
 
 		 481 aa  97.8  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  37.66 
 
 		 478 aa  97.8  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  42.22 
 
 		 493 aa  97.8  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  42.44 
 
 		 542 aa  97.8  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  35.86 
 
 		 835 aa  95.1  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  38.86 
 
 		 1451 aa  94.7  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1147 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  39.59 
 
 		 366 aa  93.2  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  40.13 
 
 		 523 aa  91.3  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  41.62 
 
 		 1101 aa  91.3  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  42.65 
 
 		 835 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  38.94 
 
 		 307 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  34.43 
 
 		 1580 aa  89.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  36.19 
 
 		 582 aa  88.2  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  43.59 
 
 		 934 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  29.32 
 
 		 426 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  44.92 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  44.1 
 
 		 835 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  44.02 
 
 		 867 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  39.2 
 
 		 647 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  53.59 
 
 		 645 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  40.07 
 
 		 1297 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  45.65 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  52.94 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  52.94 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  40.49 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  48.28 
 
 		 689 aa  82.4  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  38.55 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1773  hypothetical protein  37.7 
 
 		 355 aa  80.9  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.457956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  31.79 
 
 		 835 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  35.58 
 
 		 1170 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  41.54 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  51.22 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  43.88 
 
 		 252 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  42.56 
 
 		 1321 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  56.1 
 
 		 212 aa  76.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  46.56 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  43.19 
 
 		 951 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  52.38 
 
 		 1426 aa  74.3  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  40.74 
 
 		 303 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  48.03 
 
 		 222 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4112  hypothetical protein  48.31 
 
 		 314 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  40.78 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  51.92 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  42.29 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  31.8 
 
 		 859 aa  72  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  51.92 
 
 		 451 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  31.8 
 
 		 833 aa  71.6  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  41.03 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  51.92 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  51.92 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2235  hypothetical protein  53.73 
 
 		 347 aa  70.1  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  50.55 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  32.72 
 
 		 833 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  37.01 
 
 		 688 aa  66.6  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  34.62 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  41.75 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  43.44 
 
 		 2397 aa  64.7  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  47.32 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  25.88 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>