146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2891 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  98.44 
 
 
833 aa  1696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  96.89 
 
 
859 aa  1668    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  100 
 
 
833 aa  1721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  66.82 
 
 
447 aa  625  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  54.55 
 
 
454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  54.55 
 
 
454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  53.38 
 
 
455 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  51.19 
 
 
455 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  52.9 
 
 
457 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  49.36 
 
 
441 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  43.75 
 
 
451 aa  330  9e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2235  hypothetical protein  42.86 
 
 
347 aa  291  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1773  hypothetical protein  42.72 
 
 
355 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.457956  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4112  hypothetical protein  44.03 
 
 
314 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  29.32 
 
 
434 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  25.27 
 
 
436 aa  138  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  27.39 
 
 
444 aa  134  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  28.34 
 
 
419 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  28.19 
 
 
420 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  26.47 
 
 
434 aa  134  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  29.44 
 
 
384 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  26.3 
 
 
524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  29.82 
 
 
416 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  27.86 
 
 
414 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  27.86 
 
 
414 aa  126  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  26.67 
 
 
440 aa  124  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  28.25 
 
 
412 aa  121  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  25.81 
 
 
421 aa  120  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  25.66 
 
 
415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  26.09 
 
 
390 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  27.15 
 
 
409 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  25.36 
 
 
389 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  27.07 
 
 
408 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
425 aa  115  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
425 aa  115  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
425 aa  115  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  27.3 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  29.75 
 
 
407 aa  112  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  25 
 
 
445 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  0.00000000693474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  24.11 
 
 
413 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  26.65 
 
 
431 aa  110  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  24.11 
 
 
413 aa  109  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  26.17 
 
 
444 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  24.45 
 
 
408 aa  108  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  23.84 
 
 
413 aa  108  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  28.26 
 
 
426 aa  107  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  26.02 
 
 
423 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  25.35 
 
 
411 aa  105  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  27.11 
 
 
407 aa  105  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  25.97 
 
 
406 aa  104  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  24.94 
 
 
416 aa  104  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  27.53 
 
 
393 aa  104  9e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  26.6 
 
 
406 aa  103  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  31.82 
 
 
392 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  31.12 
 
 
393 aa  103  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  27.82 
 
 
404 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  25.48 
 
 
416 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  25.14 
 
 
413 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  25.7 
 
 
417 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  25.77 
 
 
544 aa  100  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  27.47 
 
 
412 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  26.68 
 
 
397 aa  99.4  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  27.55 
 
 
417 aa  98.6  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  25.68 
 
 
434 aa  97.8  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  28.63 
 
 
399 aa  97.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  25.99 
 
 
393 aa  97.1  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  25.48 
 
 
432 aa  96.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  28.63 
 
 
392 aa  96.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  25.82 
 
 
428 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  24.93 
 
 
434 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  25.95 
 
 
408 aa  95.5  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  25.06 
 
 
445 aa  94.4  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  25.56 
 
 
445 aa  94.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  25.47 
 
 
395 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  28.88 
 
 
398 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  25.75 
 
 
424 aa  90.9  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  26.88 
 
 
397 aa  89.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  25.76 
 
 
416 aa  88.6  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  26.04 
 
 
409 aa  88.2  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  29.53 
 
 
433 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  26.4 
 
 
411 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  26.36 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  25.34 
 
 
448 aa  85.5  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  24.24 
 
 
417 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  25.27 
 
 
391 aa  82  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  25 
 
 
391 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  25.07 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  25.07 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  22.01 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  22.62 
 
 
413 aa  77.4  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  24.79 
 
 
400 aa  77.4  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  25 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  25.57 
 
 
401 aa  73.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  24.59 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  23.1 
 
 
391 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  23.61 
 
 
391 aa  72  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  24.93 
 
 
391 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0244  hypothetical protein  27.75 
 
 
267 aa  72  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  24.43 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  22.94 
 
 
473 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>