168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1804 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  93.1 
 
 
438 aa  679    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  96.8 
 
 
451 aa  710    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  100 
 
 
434 aa  857    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  96.8 
 
 
437 aa  711    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  94.74 
 
 
439 aa  715    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  96.34 
 
 
437 aa  706    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  93.36 
 
 
437 aa  702    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  88.02 
 
 
407 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  94.12 
 
 
411 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  73 
 
 
645 aa  348  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  78.12 
 
 
1007 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  78.29 
 
 
1137 aa  239  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  87.8 
 
 
1120 aa  237  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  87.8 
 
 
1258 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  88.03 
 
 
401 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  88.03 
 
 
401 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  87.96 
 
 
845 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.116414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  76.39 
 
 
791 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  76.39 
 
 
790 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  85.45 
 
 
198 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  76.22 
 
 
892 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  75 
 
 
805 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1882  tail fiber protein  93.48 
 
 
92 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3184  tail fiber protein  93.48 
 
 
92 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000807909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5544  tail fiber protein  92.39 
 
 
92 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  54.2 
 
 
2914 aa  113  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  59.43 
 
 
2851 aa  108  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  62 
 
 
523 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  49.1 
 
 
582 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  46.62 
 
 
400 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  59.09 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  54.62 
 
 
442 aa  93.2  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  54.55 
 
 
606 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  44.2 
 
 
403 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  44.83 
 
 
1101 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  52.38 
 
 
689 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  47.89 
 
 
481 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  47.89 
 
 
478 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  38.04 
 
 
492 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  51.11 
 
 
842 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  55.56 
 
 
712 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  54.05 
 
 
813 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  48.18 
 
 
473 aa  84  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  52.25 
 
 
706 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  52.03 
 
 
512 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  52.29 
 
 
466 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  50.38 
 
 
585 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  52.89 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  53.54 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  48.78 
 
 
1147 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  50.42 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  48 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  50.43 
 
 
936 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  49.58 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  49.58 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  55 
 
 
835 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  50.49 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  37.37 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  57.14 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  45 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  46.72 
 
 
748 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  50.46 
 
 
468 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  45.32 
 
 
587 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  54.21 
 
 
643 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  47.97 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  51.04 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  46.15 
 
 
1168 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  50.93 
 
 
815 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  44.09 
 
 
524 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  51.85 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  47.75 
 
 
380 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  44.37 
 
 
319 aa  77  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  49.18 
 
 
867 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  54.95 
 
 
835 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  47.19 
 
 
717 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  42.33 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  59.72 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  47.93 
 
 
1055 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  48.15 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  50 
 
 
1451 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  52.25 
 
 
934 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  52.43 
 
 
1426 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  54.05 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  46.72 
 
 
1219 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  48.82 
 
 
1321 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  47.78 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  48.15 
 
 
252 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  37.98 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  61.9 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  56.82 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  48.15 
 
 
647 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  47.06 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  45.05 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  44.36 
 
 
835 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  51.02 
 
 
639 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  48.03 
 
 
1297 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  47.11 
 
 
222 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  46.96 
 
 
582 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  51.35 
 
 
1170 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1014  putative prophage tail fiber protein  43.02 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>