153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1008 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 380 aa  721    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  54.67 
 
 		 606 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  90.16 
 
 		 445 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0887  Collagen triple helix repeat protein  85 
 
 		 566 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  59.69 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  56.72 
 
 		 462 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  53.3 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  71.43 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  72.06 
 
 		 459 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0886  hypothetical protein  54.78 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  50.46 
 
 		 252 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  64.18 
 
 		 524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  74.56 
 
 		 639 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  75.81 
 
 		 815 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  77.31 
 
 		 1219 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  66.22 
 
 		 1055 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  57.05 
 
 		 936 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  68.66 
 
 		 326 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  50.76 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  50.8 
 
 		 512 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  40.55 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  40.55 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  60 
 
 		 469 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  59.48 
 
 		 348 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  35.66 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  46.23 
 
 		 706 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  58.14 
 
 		 712 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  44.24 
 
 		 813 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  60.96 
 
 		 647 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  49.7 
 
 		 258 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  42.55 
 
 		 748 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  45.32 
 
 		 842 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  66.09 
 
 		 1147 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  57.26 
 
 		 585 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  52.83 
 
 		 1168 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  56.25 
 
 		 643 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  42.39 
 
 		 867 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  65.22 
 
 		 1451 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  64.21 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  39.36 
 
 		 835 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  49.01 
 
 		 473 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  61.19 
 
 		 1580 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  49.19 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  32.06 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  54.64 
 
 		 717 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  76 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  48.39 
 
 		 466 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  49.32 
 
 		 474 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  48.82 
 
 		 2914 aa  89.7  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  48.41 
 
 		 582 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  43.19 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  59.63 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  46.94 
 
 		 240 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  49.64 
 
 		 523 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  37.36 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  42.44 
 
 		 295 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  41.12 
 
 		 835 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  50 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  40.28 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  42.07 
 
 		 835 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4639  collagen triple helix repeat domain protein  51.15 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  38.22 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  39.46 
 
 		 2851 aa  82  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  50.94 
 
 		 1148 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  47.5 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  44.88 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  44.53 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  42.02 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  41.1 
 
 		 645 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3260  triple helix repeat-containing collagen  47.89 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.524263  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  51.02 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  44.26 
 
 		 587 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  53.91 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2199  collagen-like protein  77.61 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.76687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  43.2 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  40 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  46.4 
 
 		 542 aa  77  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  37.16 
 
 		 767 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  49.62 
 
 		 838 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  45.56 
 
 		 1170 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  34.27 
 
 		 648 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  37.09 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2281  hypothetical protein  64.79 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  42.24 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  51.43 
 
 		 1321 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  41.18 
 
 		 1101 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  44.83 
 
 		 951 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0895  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.37 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  47.52 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  43.92 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  40.31 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  49.28 
 
 		 934 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  43.2 
 
 		 1873 aa  72.8  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1259  hypothetical protein  46.81 
 
 		 403 aa  72  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.459414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  39.53 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  52.11 
 
 		 1297 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.17 
 
 		 689 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  28.93 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  49.55 
 
 		 436 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  37.93 
 
 		 212 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>