173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2165 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  98.17 
 
 		 437 aa  847    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  95.65 
 
 		 437 aa  727    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  94.5 
 
 		 438 aa  696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  97.25 
 
 		 451 aa  717    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  96.8 
 
 		 434 aa  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  100 
 
 		 437 aa  862    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  96.11 
 
 		 439 aa  731    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  89.24 
 
 		 407 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  94.49 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  76.05 
 
 		 645 aa  372  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  80 
 
 		 1007 aa  259  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  77.5 
 
 		 1137 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  89.43 
 
 		 1120 aa  243  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  89.43 
 
 		 1258 aa  243  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  75.62 
 
 		 401 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  75.62 
 
 		 401 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  88.99 
 
 		 845 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  87.27 
 
 		 198 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  76.39 
 
 		 790 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  76.39 
 
 		 791 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  75.69 
 
 		 892 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  75 
 
 		 805 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3184  tail fiber protein  98.91 
 
 		 92 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000807909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1882  tail fiber protein  98.91 
 
 		 92 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5544  tail fiber protein  95.65 
 
 		 92 aa  187  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  54.2 
 
 		 2914 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  56.36 
 
 		 2851 aa  107  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  61 
 
 		 523 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  45.4 
 
 		 582 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  47.3 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  47.13 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  57.98 
 
 		 442 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  44.93 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  39.67 
 
 		 492 aa  91.3  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  38.59 
 
 		 493 aa  90.1  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  52.43 
 
 		 689 aa  90.1  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  53.15 
 
 		 347 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  53.15 
 
 		 347 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  53.21 
 
 		 466 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  53.23 
 
 		 842 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  53.72 
 
 		 606 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  53.72 
 
 		 344 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  52.29 
 
 		 468 aa  86.3  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  52.5 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  46.58 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  53.28 
 
 		 512 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  44.37 
 
 		 1101 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  46.58 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  53.66 
 
 		 813 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  50 
 
 		 643 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  50.82 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  49.59 
 
 		 1147 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  47.37 
 
 		 587 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  45.71 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  53.04 
 
 		 712 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  45.69 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  53.33 
 
 		 706 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  55.34 
 
 		 835 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  41.61 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  46.04 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  45.51 
 
 		 815 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  47.97 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  47.62 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  52.8 
 
 		 1168 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  56.04 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  49.17 
 
 		 936 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  50.41 
 
 		 748 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  47.32 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  51.18 
 
 		 835 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  50.49 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  50.48 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  53.15 
 
 		 934 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  47.9 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  48.44 
 
 		 867 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  48.28 
 
 		 542 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  45.65 
 
 		 717 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  39.53 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  47.32 
 
 		 647 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  54.05 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  38.82 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  46.72 
 
 		 1219 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  52.25 
 
 		 1170 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  52.25 
 
 		 1321 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  50.51 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  50.93 
 
 		 1055 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  49 
 
 		 524 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  48.72 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  48.28 
 
 		 639 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  45.11 
 
 		 835 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  52.25 
 
 		 1297 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  51.35 
 
 		 951 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  47.27 
 
 		 582 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  51.2 
 
 		 222 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  57.83 
 
 		 253 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  51.06 
 
 		 1426 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  46.67 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  47.2 
 
 		 1451 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  53.54 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  49.46 
 
 		 299 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  41.22 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>