36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1096 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  100 
 
 		 411 aa  829    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  91.18 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  81.88 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  90.81 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  82.2 
 
 		 437 aa  398  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  82.62 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  80.91 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  86.32 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  80.46 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  83.75 
 
 		 1007 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  81.25 
 
 		 1137 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  94.31 
 
 		 1120 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  76.88 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  76.88 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  89.43 
 
 		 1258 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  90.74 
 
 		 845 aa  216  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  88.18 
 
 		 198 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  77.08 
 
 		 791 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  77.08 
 
 		 790 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  76.39 
 
 		 892 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  75.69 
 
 		 805 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  38.76 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1014  putative prophage tail fiber protein  41.86 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  37.78 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  38.38 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  36.61 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2207  tail fiber family protein  34.91 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.837708  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  32.49 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  35.92 
 
 		 456 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  35 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2909  hypothetical protein  31.68 
 
 		 492 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1209  hypothetical protein  31.58 
 
 		 346 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.852584  normal  0.278976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 813 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4540  hypothetical protein  57.89 
 
 		 177 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  37.96 
 
 		 762 aa  45.8  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  66.67 
 
 		 2914 aa  43.1  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>