15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1209 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1209  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  718    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.852584  normal  0.278976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  45.83 
 
 		 1258 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  33.55 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2909  hypothetical protein  32.28 
 
 		 492 aa  59.3  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  28.05 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1636  hypothetical protein  30.14 
 
 		 471 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  26.49 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2216  hypothetical protein  29.25 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  31.43 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  34.51 
 
 		 510 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  25.66 
 
 		 650 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1690  hypothetical protein  31.94 
 
 		 462 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  26.95 
 
 		 781 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0710  gpH  40.74 
 
 		 157 aa  46.2  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  25 
 
 		 1168 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>