10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0710 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0710  gpH  100 
 
 		 157 aa  323  7e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  43.95 
 
 		 892 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  58.59 
 
 		 673 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  39.87 
 
 		 510 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  34.34 
 
 		 520 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  36.09 
 
 		 701 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  32.16 
 
 		 514 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  44.44 
 
 		 263 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2597  Bcv gene product  89.74 
 
 		 39 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1209  hypothetical protein  40.74 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.852584  normal  0.278976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>