27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3346 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1328    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  60.17 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3345  hypothetical protein  41.01 
 
 		 353 aa  243  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  40.56 
 
 		 456 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  45.59 
 
 		 323 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2351  hypothetical protein  43.61 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.428025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2350  hypothetical protein  40.14 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0668195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  29.3 
 
 		 918 aa  92.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  36.84 
 
 		 953 aa  90.9  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  34.65 
 
 		 1101 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3420  hypothetical protein  40.17 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  36.8 
 
 		 1168 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 1026 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  31.36 
 
 		 781 aa  71.6  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  26.12 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3469  Hep_Hag  36.67 
 
 		 777 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259932  normal  0.0166964 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  38.38 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  30.23 
 
 		 378 aa  54.3  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1037 aa  54.7  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3468  Hep_Hag  36 
 
 		 843 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186324  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5246  Carbohydrate-binding family V/XII  31.43 
 
 		 562 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  hitchhiker  0.0000498819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3030  hypothetical protein  45.45 
 
 		 59 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.644466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1074  hypothetical protein  37.5 
 
 		 284 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0885  hypothetical protein  28.68 
 
 		 428 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1209  hypothetical protein  25.66 
 
 		 346 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.852584  normal  0.278976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0354  hypothetical protein  34.88 
 
 		 689 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2216  hypothetical protein  35.9 
 
 		 423 aa  43.9  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>