12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2350 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2350  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0668195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2351  hypothetical protein  48.83 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.428025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  40.14 
 
 		 650 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  37.98 
 
 		 918 aa  92.8  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  38.52 
 
 		 1101 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3420  hypothetical protein  40.15 
 
 		 345 aa  89.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  32.69 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 1026 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3345  hypothetical protein  37.12 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  35.11 
 
 		 953 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3030  hypothetical protein  51.85 
 
 		 59 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.644466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2296  hypothetical protein  28.28 
 
 		 538 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>