151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1608 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  60.92 
 
 		 953 aa  892    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 1101 aa  2093    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0787  hypothetical protein  68.7 
 
 		 599 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5468  hypothetical protein  56.2 
 
 		 546 aa  364  5.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.60679 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  49.6 
 
 		 2914 aa  179  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2296  hypothetical protein  52.02 
 
 		 538 aa  164  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  52.79 
 
 		 842 aa  155  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  40.59 
 
 		 582 aa  148  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  52.86 
 
 		 813 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  53.14 
 
 		 643 aa  146  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  54.75 
 
 		 706 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  47.62 
 
 		 442 aa  136  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  48.02 
 
 		 403 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  47.72 
 
 		 835 aa  135  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  48.44 
 
 		 400 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  47.92 
 
 		 585 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  47.2 
 
 		 459 aa  129  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  48.67 
 
 		 835 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  54.63 
 
 		 1168 aa  128  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  55.28 
 
 		 748 aa  126  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  51.14 
 
 		 1147 aa  125  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  46.85 
 
 		 936 aa  125  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  48.08 
 
 		 382 aa  122  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  39.57 
 
 		 2851 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  55.31 
 
 		 478 aa  121  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  46.74 
 
 		 712 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  45.18 
 
 		 462 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  53.19 
 
 		 689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  46.38 
 
 		 606 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  50.2 
 
 		 1873 aa  119  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  47.46 
 
 		 481 aa  118  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  47.53 
 
 		 322 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  52.51 
 
 		 512 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  41.76 
 
 		 542 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  48.37 
 
 		 300 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  47.96 
 
 		 319 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  47.41 
 
 		 1026 aa  114  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  41.99 
 
 		 1219 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  45.07 
 
 		 815 aa  110  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  45.28 
 
 		 1055 aa  108  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  45.5 
 
 		 492 aa  107  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  45.45 
 
 		 1580 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  44.2 
 
 		 587 aa  106  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  34.1 
 
 		 645 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  46.92 
 
 		 867 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  48.51 
 
 		 1451 aa  104  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  43.72 
 
 		 468 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  39.7 
 
 		 426 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  39.74 
 
 		 524 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  45.62 
 
 		 838 aa  101  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  44.49 
 
 		 1170 aa  101  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  44.77 
 
 		 1297 aa  101  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  42.73 
 
 		 466 aa  100  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  46.15 
 
 		 1321 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  36.76 
 
 		 918 aa  99  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  53.96 
 
 		 344 aa  98.2  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  55.08 
 
 		 439 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  55.08 
 
 		 437 aa  95.5  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  45.09 
 
 		 582 aa  94.7  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2351  hypothetical protein  39.69 
 
 		 296 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.428025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  38.72 
 
 		 444 aa  94  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  42.21 
 
 		 835 aa  94.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  42.04 
 
 		 639 aa  93.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  48.31 
 
 		 934 aa  93.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  47.03 
 
 		 835 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  45.58 
 
 		 523 aa  93.2  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  44.81 
 
 		 474 aa  91.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  40.13 
 
 		 473 aa  91.3  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  44.28 
 
 		 493 aa  90.9  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2350  hypothetical protein  38.52 
 
 		 295 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0668195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  52.03 
 
 		 347 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  52.03 
 
 		 347 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  47.75 
 
 		 951 aa  88.6  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  34.65 
 
 		 650 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  40.25 
 
 		 298 aa  87  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3420  hypothetical protein  40.15 
 
 		 345 aa  86.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  36.31 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  50.89 
 
 		 212 aa  85.1  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  46.72 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  31.54 
 
 		 366 aa  84.7  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  47.5 
 
 		 348 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  36.64 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  50 
 
 		 451 aa  84  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  50 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  50 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  56 
 
 		 434 aa  80.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  45.71 
 
 		 252 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  49.12 
 
 		 1426 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  56.14 
 
 		 436 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  46.15 
 
 		 438 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  46.09 
 
 		 274 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  45.52 
 
 		 307 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.16 
 
 		 473 aa  73.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  45.79 
 
 		 258 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  34.36 
 
 		 469 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  58.23 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  39.88 
 
 		 767 aa  68.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3503  hypothetical protein  33.75 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00183047  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  48.57 
 
 		 222 aa  67.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  42.01 
 
 		 1788 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>