74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1681 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  58.51 
 
 		 1101 aa  873    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  100 
 
 		 953 aa  1840    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0787  hypothetical protein  57.38 
 
 		 599 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5468  hypothetical protein  53.66 
 
 		 546 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.60679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2296  hypothetical protein  48.86 
 
 		 538 aa  157  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  49.62 
 
 		 1026 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  36.84 
 
 		 650 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  35.43 
 
 		 918 aa  89.7  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2351  hypothetical protein  33.58 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.428025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3503  hypothetical protein  33.12 
 
 		 333 aa  79.7  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00183047  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3420  hypothetical protein  39.85 
 
 		 345 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  36.7 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2350  hypothetical protein  35.11 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0668195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3345  hypothetical protein  34.93 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  65.57 
 
 		 813 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  41.76 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  50.72 
 
 		 2914 aa  62.4  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6234  putative collagen-like protein  56 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  61.54 
 
 		 1426 aa  57.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  54.79 
 
 		 582 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  52.24 
 
 		 645 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  60 
 
 		 437 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  60 
 
 		 439 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  52.54 
 
 		 2851 aa  55.5  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  36.61 
 
 		 403 aa  55.8  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5441  Collagen triple helix repeat protein  47.83 
 
 		 296 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  0.0707326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  49.15 
 
 		 283 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  55.71 
 
 		 712 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  54.93 
 
 		 842 aa  53.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  50.75 
 
 		 580 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  50.72 
 
 		 434 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  30.86 
 
 		 240 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  62.71 
 
 		 706 aa  52  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  36.96 
 
 		 438 aa  52  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  48.61 
 
 		 451 aa  51.6  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  48.61 
 
 		 437 aa  51.6  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  48.61 
 
 		 437 aa  51.6  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2409  hypothetical protein  58.49 
 
 		 248 aa  50.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  55.22 
 
 		 1873 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  44.29 
 
 		 258 aa  50.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  59.68 
 
 		 512 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  45.24 
 
 		 212 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  61.22 
 
 		 436 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3237  hypothetical protein  57.41 
 
 		 208 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50 
 
 		 689 aa  49.3  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  64.44 
 
 		 585 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  53.73 
 
 		 643 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  56.6 
 
 		 319 aa  48.9  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  60.38 
 
 		 478 aa  48.9  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  52.54 
 
 		 523 aa  48.5  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  50.85 
 
 		 466 aa  47.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  53.23 
 
 		 839 aa  47.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3030  hypothetical protein  37.5 
 
 		 59 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.644466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  55 
 
 		 606 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  49.4 
 
 		 481 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  58.06 
 
 		 1147 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  51.92 
 
 		 366 aa  47.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  61.7 
 
 		 444 aa  47  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  50.82 
 
 		 468 aa  47  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2464  BclA protein  40.54 
 
 		 210 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  52.83 
 
 		 344 aa  46.2  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  47.89 
 
 		 382 aa  45.8  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  49.37 
 
 		 748 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  49.18 
 
 		 492 aa  45.8  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  45.78 
 
 		 835 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  42.67 
 
 		 462 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  54.35 
 
 		 308 aa  45.8  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  48.44 
 
 		 542 aa  45.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0602  hypothetical protein  45.24 
 
 		 449 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  46.27 
 
 		 459 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  50 
 
 		 426 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  56.72 
 
 		 1168 aa  44.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  58.33 
 
 		 558 aa  44.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1848  Collagen triple helix repeat protein  55.1 
 
 		 250 aa  44.3  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>