43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3469 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3469  Hep_Hag  100 
 
 
777 aa  1553    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259932  normal  0.0166964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3468  Hep_Hag  78.26 
 
 
843 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186324  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2109  hypothetical protein  66.4 
 
 
761 aa  456  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  63.88 
 
 
1037 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4198  hypothetical protein  57.49 
 
 
881 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26199  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3200  hypothetical protein  59.13 
 
 
824 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202972  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2049  hypothetical protein  56.18 
 
 
746 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1112  hypothetical protein  57.33 
 
 
735 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0536  hypothetical protein  45.86 
 
 
776 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664804  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2741  hypothetical protein  53.56 
 
 
804 aa  363  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.732341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1354  hypothetical protein  58.22 
 
 
647 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1914  hypothetical protein  55.06 
 
 
726 aa  357  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.785676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1334  hypothetical protein  55.67 
 
 
747 aa  356  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329059  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0354  hypothetical protein  57.79 
 
 
689 aa  341  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0191  hypothetical protein  52.93 
 
 
729 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.496537  normal  0.259383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0190  hypothetical protein  50.79 
 
 
722 aa  317  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685735  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4089  hypothetical protein  53.96 
 
 
702 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.331742  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1909  hypothetical protein  49.02 
 
 
628 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383493  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2744  hypothetical protein  49.84 
 
 
759 aa  259  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953888  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1615  hypothetical protein  42.08 
 
 
675 aa  247  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2296  hypothetical protein  32.18 
 
 
538 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3344  hypothetical protein  38.11 
 
 
434 aa  134  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4534  hypothetical protein  30.03 
 
 
361 aa  98.2  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.857374 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5099  hypothetical protein  30.07 
 
 
690 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2192  hypothetical protein  31.61 
 
 
770 aa  91.3  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000184948  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0500  hypothetical protein  32.78 
 
 
619 aa  89  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.892489  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1625  hypothetical protein  35 
 
 
579 aa  87.4  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0603  hypothetical protein  29.8 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1675  hypothetical protein  31.03 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3423  hypothetical protein  26.35 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0602  hypothetical protein  24.85 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  41.77 
 
 
456 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  36.67 
 
 
650 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4575  hemagluttinin domain-containing protein  42.7 
 
 
2493 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1014  hypothetical protein  36.25 
 
 
381 aa  52.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.963596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0441  outer membrane protein, haemagluttinin-like  34.38 
 
 
2866 aa  50.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192445  normal  0.347106 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3477  hemagluttinin domain-containing protein  35.64 
 
 
2505 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.987353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  31.58 
 
 
323 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  42.5 
 
 
1654 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  35.58 
 
 
2392 aa  45.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  31.65 
 
 
1230 aa  44.7  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3345  hypothetical protein  36.56 
 
 
353 aa  44.3  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  29.51 
 
 
3920 aa  44.3  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>