14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1675 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1675  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  889    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1625  hypothetical protein  41.32 
 
 		 579 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2765  hypothetical protein  56.42 
 
 		 299 aa  242  9e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.555951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3344  hypothetical protein  34.17 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2192  hypothetical protein  35.42 
 
 		 770 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000184948  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5099  hypothetical protein  34.82 
 
 		 690 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0500  hypothetical protein  34.62 
 
 		 619 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.892489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2025  hemagluttinin motif-containing protein  42.22 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.219525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3469  Hep_Hag  31.03 
 
 		 777 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259932  normal  0.0166964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2024  hypothetical protein  46.05 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3468  Hep_Hag  34.29 
 
 		 843 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186324  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3423  hypothetical protein  25.4 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4534  hypothetical protein  27.88 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.857374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1168 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>