30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2024 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2024  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  689    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1675  hypothetical protein  46.34 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2025  hemagluttinin motif-containing protein  38.05 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.219525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2765  hypothetical protein  35.64 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.555951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1625  hypothetical protein  39.47 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  34.53 
 
 		 1390 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  34.53 
 
 		 2504 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  34.01 
 
 		 3635 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  33.33 
 
 		 1326 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  33.1 
 
 		 4726 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  33.87 
 
 		 4191 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  33.11 
 
 		 877 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  34.25 
 
 		 536 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  33.58 
 
 		 810 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  33.03 
 
 		 2868 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  33.64 
 
 		 3355 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  32.59 
 
 		 1309 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  38.05 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  33.33 
 
 		 1440 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  33.33 
 
 		 1190 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  27.59 
 
 		 4384 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  30.08 
 
 		 1122 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  30.08 
 
 		 1122 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  30.08 
 
 		 1122 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  30.08 
 
 		 1090 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  30.08 
 
 		 1090 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  31.79 
 
 		 3126 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  35.71 
 
 		 655 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  30.08 
 
 		 1074 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  30.08 
 
 		 1090 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>