20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1625 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1625  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1179    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1675  hypothetical protein  41.32 
 
 
435 aa  317  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2765  hypothetical protein  49.19 
 
 
299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.555951  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5099  hypothetical protein  44.95 
 
 
690 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2192  hypothetical protein  44.9 
 
 
770 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000184948  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3344  hypothetical protein  43.4 
 
 
434 aa  91.3  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3469  Hep_Hag  35 
 
 
777 aa  87.4  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259932  normal  0.0166964 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3468  Hep_Hag  36.43 
 
 
843 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186324  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4534  hypothetical protein  36.75 
 
 
361 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal  0.857374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0500  hypothetical protein  37.04 
 
 
619 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.892489  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2025  hemagluttinin motif-containing protein  40.23 
 
 
259 aa  65.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.219525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0603  hypothetical protein  30.47 
 
 
427 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3423  hypothetical protein  31.97 
 
 
468 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0602  hypothetical protein  25 
 
 
449 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.146379  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2024  hypothetical protein  39.47 
 
 
347 aa  57.8  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1519  hypothetical protein  25.14 
 
 
1910 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.387558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  23.45 
 
 
1168 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  26.34 
 
 
461 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1517  hypothetical protein  29.63 
 
 
895 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  30.77 
 
 
781 aa  43.9  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>