12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3856 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  922    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  34.06 
 
 		 781 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1168 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  26.12 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  27.65 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2909  hypothetical protein  29.36 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  27.31 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1209  hypothetical protein  28.05 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.852584  normal  0.278976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  26.01 
 
 		 323 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1625  hypothetical protein  26.34 
 
 		 579 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1037 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  32.67 
 
 		 378 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>