33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0183 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0183  hypothetical protein  100 
 
 		 1168 aa  2318    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3850  complement C1q protein  28.74 
 
 		 781 aa  92  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3029  hypothetical protein  38.1 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2529  hypothetical protein  39.32 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0585489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3346  hypothetical protein  36.8 
 
 		 650 aa  77.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3344  hypothetical protein  36.13 
 
 		 397 aa  74.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0352  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1037 aa  72  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197071  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5053  hypothetical protein  31.93 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3503  hypothetical protein  61.29 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000360551  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3856  hypothetical protein  28.82 
 
 		 461 aa  71.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0354  hypothetical protein  31.06 
 
 		 689 aa  63.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3297  hypothetical protein  40.58 
 
 		 496 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151351  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5246  Carbohydrate-binding family V/XII  26.03 
 
 		 562 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  hitchhiker  0.0000498819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1065  hypothetical protein  25.82 
 
 		 343 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3344  hypothetical protein  54.55 
 
 		 434 aa  53.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2104  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  52.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415713  normal  0.408246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1054  hypothetical protein  27.44 
 
 		 299 aa  52  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.52466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2216  hypothetical protein  28.17 
 
 		 423 aa  50.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1625  hypothetical protein  23.45 
 
 		 579 aa  49.7  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0885  hypothetical protein  29.41 
 
 		 428 aa  49.7  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5468  hypothetical protein  37.97 
 
 		 546 aa  50.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.60679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5661  hypothetical protein  44.23 
 
 		 249 aa  49.3  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0787  hypothetical protein  42.31 
 
 		 599 aa  48.9  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1056  hypothetical protein  29.81 
 
 		 317 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1064  hypothetical protein  25.36 
 
 		 399 aa  48.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02580  hypothetical protein  31.91 
 
 		 247 aa  47.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1481  hypothetical protein  53.19 
 
 		 436 aa  47.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164016  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1519  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1910 aa  47.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.387558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1515  hypothetical protein  25 
 
 		 873 aa  47  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2339  hypothetical protein  52.08 
 
 		 227 aa  46.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1675  hypothetical protein  24.35 
 
 		 435 aa  45.8  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3800  hypothetical protein  29.07 
 
 		 515 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445547  normal  0.2386 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5662  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  44.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>